RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613214.4

TNXB-209, Transcript of tenascin XB, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TNXB, Length 6,842 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXB-209ENST00000613214 TCHHQ07283 1943 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 FCGR2AP12318 317 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 CD38P28907 300 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 SLC16A14Q7RTX9 510 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 GINS3Q9BRX5 216 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 FAM166BA8MTA8 275 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 HPGDSO60760 199 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 ITGB2P05107 769 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 GAAP10253 952 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 HRH2P25021 359 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 INIPQ9NRY2 104 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 PLA2G7Q13093 441 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 ACOT4Q8N9L9 421 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 MDGA1Q8NFP4 955 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 MTHFD2P13995 350 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 IDUAP35475 653 aa14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 EEDO75530 441 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 SNAPC5O75971 98 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 LGALS4P56470 323 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 ARL16Q0P5N6 197 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 RGNQ15493 299 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 ZNF783Q6ZMS7 281 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 FIBINQ8TAL6 211 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 RAB3DO95716 219 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 HNF1AP20823 631 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 OR1D5P58170 312 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 INCA1Q0VD86 236 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 PNCKQ6P2M8 343 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 TRILQ7L0X0 811 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 EHFQ9NZC4 300 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 SLIT2O94813 1529 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 B4DXG7 233 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 CNIH1O95406 144 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 EFNA3P52797 238 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 MC2RQ01718 297 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 FADDQ13158 208 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 GPR26Q8NDV2 337 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 TMEM239Q8WW34 195 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 LGALS12Q96DT0 336 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 PREBQ9HCU5 417 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 P2RX1P51575 399 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 TAS2R20P59543 309 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 RPP30P78346 268 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 TLE1Q04724 770 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 HAPLN2Q9GZV7 340 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 AIG1Q9NVV5 245 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 HIDE1A8MVS5 230 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 E9PI62 339 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 MYBPHQ13203 477 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 BMFQ96LC9 184 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 CACNG6Q9BXT2 260 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 HRH4Q9H3N8 390 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 APMAPQ9HDC9 416 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 LGALS8O00214 317 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 DENRO43583 198 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 SUSD5O60279 629 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 ACPPP15309 386 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 TCN2P20062 427 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 CRABP1P29762 137 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 CTBSQ01459 385 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 TMEM104Q8NE00 496 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 FETUBQ9UGM5 382 aa14.49□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 TFP02787 698 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 PDE7AQ13946 482 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 IL34Q6ZMJ4 242 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 FAM185AQ8N0U4 392 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 WDSUB1Q8N9V3 476 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 GIMAP5Q96F15 307 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 A8MXE2 369 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 VEGFCP49767 419 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 AKR1C1Q04828 323 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 NARFLQ9H6Q4 476 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 NDUFB2O95178 105 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 FOSL1P15407 271 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 MLF1P58340 268 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 POU4F3Q15319 338 aa14.48□□□□□ -0.09
TNXB-209ENST00000613214 ENTPD8Q5MY95 495 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms