RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 MTERF3Q96E29 417 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CHMP6Q96FZ7 201 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 FAIMQ9NVQ4 179 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 OXSMQ9NWU1 459 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS50Q9UI38 385 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 TMED5Q9Y3A6 229 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 FIS1Q9Y3D6 152 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A096LNT2 108 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PNR3 127 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA8OA6NCC3 632 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 A8MV72 311 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 NPIPB9F8W1W9 429 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA8NF8WBI6 632 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCD4O14678 606 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 AZIN1O14977 448 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CYTIPO60759 359 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00032P0C843 101 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 BCKDHAP12694 445 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CPA3P15088 417 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 COX5AP20674 150 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 IGHV1-2P23083 117 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 EDNRAP25101 427 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC7A1P30825 629 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ASMTP46597 345 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CCT5P48643 541 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP12AP54707 1039 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH11P55287 796 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 C21orf58P58505 322 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFAF6Q330K2 333 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GALNTL6Q49A17 601 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A53Q5H9E4 307 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMM23BQ5SRD1 257 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 DCST2Q5T1A1 773 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 KANK2Q63ZY3 851 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 SSX8Q7RTT4 187 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 TXLNGYQ9BZA5 131 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 NPAP1Q9NZP6 1156 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP6V1HQ9UI12 483 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ALPK2Q86TB3 2170 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 PLCE1Q9P212 2302 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF724A8MTY0 619 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ESPNB1AK53 854 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 C9JVG2 144 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 SSX4O60224 188 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GPRIN2O60269 458 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 PGM3O95394 542 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CHEK2O96017 543 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM153BP0C7A2 387 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM157CP0CG43 387 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 GGT1P19440 569 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CRHR1P34998 444 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 HPCAL1P37235 193 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 NUDT6P53370 316 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 TP53BP2Q13625 1128 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CBFBQ13951 182 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 QPRTQ15274 297 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM153CQ494X1 144 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 AGAP6Q5VW22 663 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 C3orf33Q6P1S2 294 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 P2RY8Q86VZ1 359 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 C10orf107Q8IVU9 208 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF614Q8N883 585 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC63Q8NA47 563 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 OR7A2PQ8NGA2 310 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10H5Q8NGA6 315 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5W2Q8NH69 310 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms