RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 DTX2Q86UW9 622 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC63Q8NA47 563 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MTERF3Q96E29 417 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ALG2Q9H553 416 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL9Q9P2J3 617 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TMED5Q9Y3A6 229 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.7■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 BCKDHAP12694 445 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CRHR1P34998 444 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 RAC3P60763 192 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SELENBP1Q13228 472 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PPA1Q15181 289 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 OR7A2PQ8NGA2 310 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MRGPRX4Q96LA9 322 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXD1Q9GZZ0 328 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 NPAP1Q9NZP6 1156 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1HQ9UI12 483 aa22.69■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 STAB1Q9NY15 2570 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 C9JVG2 144 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 NPIPB9F8W1W9 429 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BNH8 94 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 IFNA2P01563 188 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 FESP07332 822 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC7A1P30825 629 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ASMTP46597 345 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT5P48643 541 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CDH11P55287 796 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF614Q8N883 585 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GRIP2Q9C0E4 1043 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa22.68■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM233B4DJY2 109 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SSX4O60224 188 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GPRIN2O60269 458 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 LAMP1P11279 417 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 IGHV1-2P23083 117 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 HPCAL1P37235 193 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP12AP54707 1039 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53BP2Q13625 1128 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 QPRTQ15274 297 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A53Q5H9E4 307 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 IFT20Q8IY31 132 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CNPY4Q8N129 248 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ADAMTS15Q8TE58 950 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 DTNAQ9Y4J8 743 aa22.67■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A096LNT2 108 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MV72 311 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCD4O14678 606 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CYTIPO60759 359 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 H6PDO95479 791 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CHEK2O96017 543 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 SHBGP04278 402 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 COX5AP20674 150 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PCLAFQ15004 111 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 DDIASQ8IXT1 998 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5W2Q8NH69 310 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 FAIMQ9NVQ4 179 aa22.66■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA1O95477 2261 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 FREM1Q5H8C1 2179 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNGP07510 517 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CCR4P51679 360 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRFAM7AQ494W8 412 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM23BQ5SRD1 257 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 OR56A1Q8NGH5 318 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2W6PQ8NHA6 318 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMA8Q8TAA3 256 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 TWIST2Q8WVJ9 160 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MUCL1Q96DR8 90 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 OR5B2Q96R09 309 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 MXRA5Q9NR99 2828 aa22.65■■□□□ 1.22
CAPNS1-211ENST00000590874 COPEO14579 308 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 PIP5K1BO14986 540 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF264O43296 627 aa22.64■■□□□ 1.21
CAPNS1-211ENST00000590874 C6orf47O95873 294 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms