RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 GALPQ9UBC7 116 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 OPTCQ9UBM4 332 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 IKZF3Q9UKT9 509 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TIMM22Q9Y584 194 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 NOTCH4Q99466 2003 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 C2orf16Q68DN1 1984 aa3.82□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A0U1RQS6 177 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PP18 115 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 WASH3PC4AMC7 463 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC28A1O00337 649 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TXNDC9O14530 226 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF197O14709 1029 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ACOT8O14734 319 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS14O43566 566 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SSX5O60225 188 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 EEDO75530 441 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FTH1P02794 183 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 UGT2B4P06133 528 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 CAPN1P07384 714 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ANXA5P08758 320 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LINC00271P0C7V0 271 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 ACP2P11117 423 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 IRF2P14316 349 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 UQCRBP14927 111 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CD1EP15812 388 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FUT1P19526 365 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 HNMTP50135 292 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 PMP22Q01453 160 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF415Q09FC8 603 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 RCAN2Q14206 197 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 CDKL4Q5MAI5 379 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LPCAT4Q643R3 524 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SBSNQ6UWP8 590 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FUNDC1Q8IVP5 155 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 CFAP206Q8IYR0 622 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 RAB7BQ96AH8 199 aa3.81□□□□□ -1.8
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CAPNS1-210ENST00000590211 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 ZBTB18Q99592 522 aa3.81□□□□□ -1.8
CAPNS1-210ENST00000590211 TXN2Q99757 166 aa3.81□□□□□ -1.8
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