RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 LAT2Q9GZY6 243 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SERHL2Q9H4I8 314 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 Q9H521 79 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 C12orf10Q9HB07 376 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 MKLN1Q9UL63 735 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SH3GLB1Q9Y371 365 aa6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR2W5A6NFC9 320 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NPIPB9F8W1W9 429 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 M0R3G1 203 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HRKO00198 91 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KLK10O43240 276 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FCMRO60667 390 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 OR2J2O76002 312 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IGF2P01344 180 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ADRB1P08588 477 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 LINGO3P0C6S8 592 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SFTPCP11686 197 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ANXA8P13928 327 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 EVI2BP34910 448 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RBM34P42696 430 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RFX3P48380 749 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HMGA2P52926 109 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CASP9P55211 416 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TAS2R41P59536 307 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ATP1A4Q13733 1029 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 DGCR6Q14129 220 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FGFBP1Q14512 234 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TRAM2Q15035 370 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NPTX1Q15818 432 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 NRF1Q16656 503 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 WBP2NLQ6ICG8 309 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TCTN3Q6NUS6 607 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ULK3Q6PHR2 472 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CARM1Q86X55 608 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC43A2Q8N370 569 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT16Q8N428 558 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC38A4Q969I6 547 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MISP3Q96FF7 219 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PRRC1Q96M27 445 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 C5orf34Q96MH7 638 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RASL10BQ96S79 203 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ARHGDIGQ99819 225 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC19A3Q9BZV2 496 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KLHL4Q9C0H6 718 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PRAMEF25A6NGN4 478 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 G3V2T6 193 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 WWP2O00308 870 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FADS1O60427 444 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS23O95084 383 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GADD45GO95257 159 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 HPRP00739 348 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 GSTM3P21266 225 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 FPR1P21462 350 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 VHLP40337 213 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 P2RX1P51575 399 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 RAD23AP54725 363 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CLDN6P56747 220 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 TMPRSS3P57727 454 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 CDC20Q12834 499 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 COX10Q12887 443 aa6.7□□□□□ -1.34
SMAD4-210ENST00000590061 MFAP5Q13361 173 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms