RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MVJ9 347 aa10.49□□□□□ -0.73
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CAPNS1-209ENST00000590049 STMN2Q93045 179 aa10.48□□□□□ -0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF145Q96MT1 663 aa10.48□□□□□ -0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 POLE3Q9NRF9 147 aa10.48□□□□□ -0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 ADPRHL2Q9NX46 363 aa10.48□□□□□ -0.73
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC13A4Q9UKG4 626 aa10.48□□□□□ -0.73
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