RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 GXYLT2A0PJZ3 443 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 LINC00862A6NCI5 91 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 H0YGG7 62 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 HRKO00198 91 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 GMFGO60234 142 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 PLATP00750 562 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 RIN1Q13671 783 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ALG11Q2TAA5 492 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 KLHL12Q53G59 568 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 SLC27A4Q6P1M0 643 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 FIGLAQ6QHK4 219 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 FRRS1Q6ZNA5 592 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 GDF7Q7Z4P5 450 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 GLCCI1Q86VQ1 547 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CYB561A3Q8NBI2 242 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 OR4N2Q8NGD1 307 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 C10orf90Q96M02 699 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 FRMD6Q96NE9 622 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 OR2A5Q96R48 311 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 HCAR1Q9BXC0 346 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 HRASLS2Q9NWW9 162 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 KCNE5Q9UJ90 142 aa13.99□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CELP19835 753 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 SMSP52788 366 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ENPP2Q13822 863 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 FCRL6Q6DN72 434 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 C1orf94Q6P1W5 598 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZS52 159 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ZNF680Q8NEM1 530 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 OR51G2Q8NGK0 314 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 OR51A7Q8NH64 312 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 SGTBQ96EQ0 304 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ZNF416Q9BWM5 594 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 NT5DC2Q9H857 520 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 FBXL4Q9UKA2 621 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CD8B2A6NJW9 211 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 REM1O75628 298 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CLUP10909 449 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CD8BP10966 210 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ZNF273Q14593 569 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 GXYLT1Q4G148 440 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 MFSD12Q6NUT3 480 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 LRFN4Q6PJG9 635 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ZNF836Q6ZNA1 936 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CPOQ8IVL8 374 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ABCA7Q8IZY2 2146 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 OR56A1Q8NGH5 318 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 OR51L1Q8NGJ5 315 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 DIO2Q92813 273 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 KLHL15Q96M94 604 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 PTCHD1Q96NR3 888 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 BCL2L14Q9BZR8 327 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 IL21RQ9HBE5 538 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 SMURF1Q9HCE7 757 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 FAM60AQ9NP50 221 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 RDH8Q9NYR8 311 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 COMMD3Q9UBI1 195 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 KLK4Q9Y5K2 254 aa13.98□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 A0A0G2JPF8 293 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CASC3O15234 703 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 MPZL2O60487 215 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 TBX19O60806 448 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ACP2P11117 423 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 MTNR1AP48039 350 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CDH11P55287 796 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 NDUFAF6Q330K2 333 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 CCDC36Q8IYA8 594 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 OR4K14Q8NGD5 310 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 SLC41A3Q96GZ6 507 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 WDR92Q96MX6 357 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 MND1Q9BWT6 205 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ACTRT3Q9BYD9 372 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 C12orf49Q9H741 205 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ACTR10Q9NZ32 417 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 KCMF1Q9P0J7 381 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 TMEM5Q9Y2B1 443 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 FANCMQ8IYD8 2048 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 A0A1W2PQ09 198 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 LRRN3E7EW58 273 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 GMDSO60547 372 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 MYL12AP19105 171 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 ARHGDIBP52566 201 aa13.97□□□□□ -0.17
CTIF-205ENST00000587860 LIMK1P53667 647 aa13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms