RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CCL7	P80098	99 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EPS8	Q12929	822 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NR1D2	Q14995	579 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ZIC1	Q15915	447 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LIPJ	Q5W064	366 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EPGN	Q6UW88	154 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		Q6ZSR9	355 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PLD3	Q8IV08	490 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RNF175	Q8N4F7	328 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AVL9	Q8NBF6	648 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR7G3	Q8NG95	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MOAP1	Q96BY2	351 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	WDR34	Q96EX3	536 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HBEGF	Q99075	208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DDO	Q99489	341 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GFI1	Q99684	422 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EBF4	Q9BQW3	602 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DPH7	Q9BTV6	452 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CENPO	Q9BU64	300 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RAB11FIP5	Q9BXF6	653 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FAM107B	Q9H098	131 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FAM60A	Q9NP50	221 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	BTRC	Q9Y297	605 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		4.11	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0G2JND7	137 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A0A0J9YVX5	310 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		A8MU76	341 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		H0YIV9	168 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934		J3QR06	171 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SDHD	O14521	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ACOT8	O14734	319 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HDAC3	O15379	428 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	OR1F1	O43749	312 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SNX3	O60493	162 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	DIAPH2	O60879	1101 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CTSV	O60911	334 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	SH3BGRL	O75368	114 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CRCP	O75575	148 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ATP6AP2	O75787	350 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ETHE1	O95571	254 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	FAM107A	O95990	144 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	PDYN	P01213	254 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KRT6A	P02538	564 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	STATH	P02808	62 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KRT6B	P04259	564 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	ALPPL2	P10696	532 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	UROS	P10746	265 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CD1E	P15812	388 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CKMT2	P17540	419 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	MAG	P20916	626 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CXCR2	P25025	360 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CMPK1	P30085	196 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HMOX2	P30519	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HNF4A	P41235	474 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	KRT6C	P48668	564 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	CCR8	P51685	355 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	AQP5	P55064	265 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	HMGCS1	Q01581	520 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.1	□□□□□ -1.75
LINS1-210	ENST00000560934	IGSF11	Q5DX21	431 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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