RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SFXN2Q96NB2 322 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 NANOGQ9H9S0 305 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 CMTM6Q9NX76 183 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 VAPAQ9P0L0 249 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SLAMF8Q9P0V8 285 aa8.36□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 LIPT1Q9Y234 373 aa8.36□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 C1orf226A1L170 272 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 TGM6O95932 706 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 FESP07332 822 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 FAM58BPP0C7Q3 252 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 DPP4P27487 766 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 STARP49675 285 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 C2orf80Q0P641 193 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 PGS1Q32NB8 556 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF385BQ569K4 471 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 C6orf10Q5SRN2 563 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 UBQLNLQ8IYU4 475 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 TP53INP1Q96A56 240 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SPATA9Q9BWV2 254 aa8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 OSBPL11Q9BXB4 747 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 DCLRE1BQ9H816 532 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 ACTR3BQ9P1U1 418 aa8.35□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 SSX4O60224 188 aa8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 SH3BGRLO75368 114 aa8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 IGHV4-39P01824 125 aa8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC30A6Q6NXT4 461 aa8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 CALHM3Q86XJ0 350 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 PRR22Q8IZ63 422 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TRIML2Q8N7C3 387 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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SMAD3-215ENST00000560424 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 PANX1Q96RD7 426 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 CHODLQ9H9P2 273 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 TAS2R9Q9NYW1 312 aa8.34□□□□□ -1.07
SMAD3-215ENST00000560424 SH3BP4Q9P0V3 963 aa8.34□□□□□ -1.07
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