RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	MKLN1	Q9UL63	735 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	LIPT1	Q9Y234	373 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	ROS1	P08922	2347 aa		10.28	□□□□□ -0.76
CS-223	ENST00000551137	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	C16orf97	H3BN30	126 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	HMGN4	O00479	90 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TNFSF11	O14788	317 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CASK	O14936	926 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	NUDT14	O95848	222 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZCCHC18	P0CG32	403 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PGM1	P36871	562 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MRPL19	P49406	292 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	KHK	P50053	298 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CARD18	P57730	90 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	FUT5	Q11128	374 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CBFB	Q13951	182 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	QPRT	Q15274	297 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GPR68	Q15743	365 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MAPK14	Q16539	360 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GSTA3	Q16772	222 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MAVS	Q7Z434	540 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MGARP	Q8TDB4	240 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	RNF128	Q8TEB7	428 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	NRGN	Q92686	78 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ARL8A	Q96BM9	186 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZBTB9	Q96C00	473 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	C7orf26	Q96N11	449 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PANX1	Q96RD7	426 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	OR10A4	Q9H209	315 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	LIME1	Q9H400	295 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	WDR45	Q9Y484	360 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ACAN	P16112	2415 aa		10.27	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC22A3	O75751	556 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TGDS	O95455	350 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CSTA	P01040	98 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	POU2F1	P14859	743 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PPP3CB	P16298	524 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	FKBP2	P26885	142 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SHC1	P29353	583 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CCKAR	P32238	428 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ART1	P52961	327 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CTBP2	P56545	445 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	RAC3	P60763	192 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SIRPA	P78324	504 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SELENBP1	Q13228	472 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	EPGN	Q6UW88	154 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	CMIP	Q8IY22	773 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	SLC43A2	Q8N370	569 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF614	Q8N883	585 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZFP90	Q8TF47	636 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TMEM234	Q8WY98	164 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	RAB8B	Q92930	207 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZG16B	Q96DA0	208 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MARK4	Q96L34	752 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZBTB18	Q99592	522 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	THUMPD3	Q9BV44	507 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	FANCF	Q9NPI8	374 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	ZNF226	Q9NYT6	803 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	AGAP5	A6NIR3	686 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	OPN1LW	P04000	364 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CS-223	ENST00000551137	KIT	P10721	976 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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