RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 PSKH1P11801 424 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PPP3CBP16298 524 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CPT2P23786 658 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KCNJ10P78508 379 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 QPRTQ15274 297 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DPF1Q92782 380 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC41A3Q96GZ6 507 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LHX9Q9NQ69 397 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TREX1Q9NSU2 369 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MBD2Q9UBB5 411 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TBC1D29Q9UFV1 150 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR5H15A6NDH6 313 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FAM166BA8MTA8 275 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 UTS2O95399 124 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ABHD16AO95870 558 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SHBGP04278 402 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DNASE1P24855 282 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GCGRP47871 477 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NR1H2P55055 460 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MTPNP58546 118 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DAG1Q14118 895 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FZD2Q14332 565 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RAB35Q15286 201 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MICAQ29983 383 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 UNC50Q53HI1 259 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GUSBP11Q6P575 273 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ABHD17CQ6PCB6 329 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FAM46BQ96A09 425 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CIB1Q99828 191 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC5A7Q9GZV3 580 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MOKQ9UQ07 419 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 A0A0G2JMP0 313 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1B0GVC2 190 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RPS17P08708 135 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NPR2P20594 1047 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SERPINF1P36955 418 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 BNIP3Q12983 259 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GRB7Q14451 532 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR4M2Q8NGB6 313 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CALHM2Q9HA72 323 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CISD3P0C7P0 127 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FUT1P19526 365 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KDELR2P33947 212 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MAP2K3P46734 347 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CSNK1G2P78368 415 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM19Q96HH6 336 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM68Q96MH6 324 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR4K3Q96R72 315 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MCUBQ9NWR8 336 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CACFD1Q9UGQ2 172 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SNPHO15079 494 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LRRTM2O43300 516 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CEACAM5P06731 702 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RELAQ04206 551 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CPZQ66K79 652 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC35F3Q8IY50 421 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MFSD8Q8NHS3 518 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM202A6NGA9 273 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CH25HO95992 272 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 POU3F4P49335 361 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TUBA3CQ13748 450 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 AP1ARQ63HQ0 302 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OGFOD2Q6N063 350 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms