RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RMND5AQ9H871 391 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 EXD2Q9NVH0 621 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MKLN1Q9UL63 735 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FREM3P0C091 2139 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HMGN4O00479 90 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NR5A2O00482 541 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 STX11O75558 287 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ACTL6AO96019 429 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NGFRP08138 427 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ATP12AP54707 1039 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NUP107P57740 925 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LRRC74AQ0VAA2 488 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CD226Q15762 336 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NDUFAF6Q330K2 333 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GPAT3Q53EU6 434 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KLHL26Q53HC5 615 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ARSKQ6UWY0 536 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HMGN2P46Q86SG4 172 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 EID3Q8N140 333 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GTF2H4Q92759 462 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ROPN1LQ96C74 230 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ZG16BQ96DA0 208 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SPDL1Q96EA4 605 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SFXN2Q96NB2 322 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KCNE5Q9UJ90 142 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 VDAC3Q9Y277 283 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ATRQ13535 2644 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DNAJC13O75165 2243 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 AHRRA9YTQ3 701 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HCRTR2O43614 444 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 WDR1O75083 606 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KRT75O95678 551 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 C8BP07358 591 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GLI4P10075 376 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ETFAP13804 333 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GABRA1P14867 456 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 DNASE1P24855 282 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LCN1P31025 176 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GCKP35557 465 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CRATP43155 626 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 KHKP50053 298 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ATP4BP51164 291 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ARFIP2P53365 341 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 GFRA1P56159 465 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 FUT5Q11128 374 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SQLEQ14534 574 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SYPL1Q16563 259 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 NHSL2Q5HYW2 709 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PAGE3Q5JUK9 113 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 C1orf185Q5T7R7 199 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RAET1LQ5VY80 246 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CGB2Q6NT52 195 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 AAGABQ6PD74 315 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 CBLN3Q6UW01 205 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 PLXDC2Q6UX71 529 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 SPATC1Q76KD6 591 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ULK2Q8IYT8 1036 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 ANKFN1Q8N957 763 aa8.69□□□□□ -1.02
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CS-217ENST00000550044 ZFP90Q8TF47 636 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 RND1Q92730 232 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-217ENST00000550044 TRIB1Q96RU8 372 aa8.69□□□□□ -1.02
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