RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 SLC17A5Q9NRA2 495 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.41■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 PNPP00491 289 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 ADRA2CP18825 462 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 NTF4P34130 210 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 FNTAP49354 379 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 ARL4CP56559 192 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 TRAF3Q13114 568 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 GPR151Q8TDV0 419 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 DUX5Q96PT3 197 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 EQTNQ9NQ60 294 aa20.4■□□□□ 0.86
PRDM4-202ENST00000547188 ZSCAN12O43309 604 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 OIP5O43482 229 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 NUDT14O95848 222 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 NUDT17P0C025 328 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 EFNB3Q15768 340 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 OR2L13Q8N349 312 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SELENOMQ8WWX9 145 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 CPNE1Q99829 537 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 TREM2Q9NZC2 230 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 AMDHD2Q9Y303 409 aa20.39■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
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PRDM4-202ENST00000547188 NGFRP08138 427 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 GP5P40197 560 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 IL1RL1Q01638 556 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF117Q03924 483 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 OCLNQ16625 522 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 FBLN7Q53RD9 439 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 OR51F2Q8NH61 342 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF524Q96C55 264 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 HHATLQ9HCP6 504 aa20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SH3PXD2BA1X283 911 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 MYO1GB0I1T2 1018 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ESPNB1AK53 854 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 KLF11O14901 512 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 HPGDP15428 266 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 CBLN3Q6UW01 205 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 C1QL4Q86Z23 238 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 RHEBL1Q8TAI7 183 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 C16orf78Q8WTQ4 265 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 OR5B2Q96R09 309 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 MALT1Q9UDY8 824 aa20.37■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 hCG_2039718K7EN88 272 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PCDH7O60245 1069 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 H6PDO95479 791 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 GAAP10253 952 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SSTR1P30872 391 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 KHKP50053 298 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 C1QL2Q7Z5L3 287 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SLC35F6Q8N357 371 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 FBXO30Q8TB52 745 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ELP4Q96EB1 424 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 BRF2Q9HAW0 419 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 EMC3Q9P0I2 261 aa20.36■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PDE5AO76074 875 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 CHN1P15882 459 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SELENBP1Q13228 472 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 HEPACAMQ14CZ8 416 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ADRM1Q16186 407 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 IKBIPQ70UQ0 350 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 MISPQ8IVT2 679 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PHF21BQ96EK2 531 aa20.35■□□□□ 0.85
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PRDM4-202ENST00000547188 KCNS3Q9BQ31 491 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 EBPLQ9BY08 206 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 TPK1Q9H3S4 243 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 GLIPR2Q9H4G4 154 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 G6PC2Q9NQR9 355 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PDLIM1O00151 329 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PPP6CO00743 305 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SCDO00767 359 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SAGP10523 405 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PRKCAP17252 672 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 SLC1A3P43003 542 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 PRPS1P60891 318 aa20.34■□□□□ 0.85
PRDM4-202ENST00000547188 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.34■□□□□ 0.85
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