RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532457.5

PACSIN3-209, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-209ENST00000532457 ZZEF1O43149 2961 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 DENRO43583 198 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 NDUFB5O43674 189 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 GMFGO60234 142 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 IGFBP5P24593 272 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 EPHA2P29317 976 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC36A3Q495N2 470 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ZER1Q7Z7L7 766 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 SIRT6Q8N6T7 355 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 LSMEM1Q8N8F7 131 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 AQP11Q8NBQ7 271 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 DUSP19Q8WTR2 217 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM255BQ8WV15 326 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 GPA33Q99795 319 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ADI1Q9BV57 179 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 LAT2Q9GZY6 243 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 GALNT9Q9HCQ5 603 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 POLHQ9Y253 713 aa20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 K7ENP7 123 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CLIC3O95833 236 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 PTGDSP41222 190 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 HSPA13P48723 471 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 PGBD2Q6P3X8 592 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 IL20RBQ6UXL0 311 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 OR4K5Q8NGD3 323 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 NR4A3Q92570 626 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 TTC9Q92623 222 aa20.05■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
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PACSIN3-209ENST00000532457 A0A1B0GX12 115 aa20.04■□□□□ 0.8
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PACSIN3-209ENST00000532457 RRADP55042 308 aa20.04■□□□□ 0.8
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PACSIN3-209ENST00000532457 OR5M10Q6IEU7 315 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.04■□□□□ 0.8
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PACSIN3-209ENST00000532457 TMEM27Q9HBJ8 222 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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PACSIN3-209ENST00000532457 MED13Q9UHV7 2174 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ARRDC5A6NEK1 342 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 H3BNH8 94 aa20.04■□□□□ 0.8
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PACSIN3-209ENST00000532457 MST1P26927 711 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF613Q6PF04 617 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CADM2Q8N3J6 435 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 TRIM2Q9C040 744 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 KRT84Q9NSB2 600 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 KIF17Q9P2E2 1029 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 HCRTR2O43614 444 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF440Q8IYI8 595 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 SLC38A4Q969I6 547 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ANKRD19PQ9H560 264 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 LRCH1Q9Y2L9 728 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 EML6Q6ZMW3 1958 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 PIP5K1CO60331 668 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CAPGP40121 348 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 SSR4P51571 173 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 LINC00114Q6XXX2 140 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CLEC1AQ8NC01 280 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CNBD2Q96M20 576 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 RDH12Q96NR8 316 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-209ENST00000532457 E9PQ18 207 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-209ENST00000532457 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-209ENST00000532457 IFNA8P32881 189 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-209ENST00000532457 CASP3P42574 277 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-209ENST00000532457 CCR4P51679 360 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-209ENST00000532457 CXADRP78310 365 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-209ENST00000532457 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-209ENST00000532457 ZNF730Q6ZMV8 503 aa20.02■□□□□ 0.79
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