RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	SERPINA2	P20848	420 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	PRPH	P41219	470 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	RGR	P47804	291 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	RGS4	P49798	205 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	DPYSL3	Q14195	570 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	SELPLG	Q14242	412 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	NDUFA9	Q16795	377 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	ISX	Q2M1V0	245 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF677	Q86XU0	584 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR22	Q8IZ63	422 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	MTURN	Q8N3F0	131 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	IPMK	Q8NFU5	416 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	B3GALT6	Q96L58	329 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR2DL4	Q99706	377 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC6A7	Q99884	636 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	NXF5	Q9H1B4	397 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	CELA1	Q9UNI1	258 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	ALG6	Q9Y672	507 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	ATP10D	Q9P241	1426 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		3.16	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PTPRK-215	ENST00000498284	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284		K7EQM0	130 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LAT	O43561	262 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LRAT	O95237	230 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ADCY5	O95622	1261 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF19	P17023	458 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	NT5E	P21589	574 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TBXA2R	P21731	343 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	UQCRC2	P22695	453 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ADORA2B	P29275	332 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	UGT1A3	P35503	534 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	HPCAL1	P37235	193 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	P2RY4	P51582	365 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CBX1	P83916	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LAGE3	Q14657	143 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF79	Q15937	498 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MS4A14	Q96JA4	679 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SENP8	Q96LD8	212 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	C12orf66	Q96MD2	445 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZIM3	Q96PE6	472 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF607	Q96SK3	696 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RIT2	Q99578	217 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	IL17C	Q9P0M4	197 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RNF14	Q9UBS8	474 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	AKNA	Q7Z591	1439 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		3.15	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ABCA8	O94911	1581 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	EPOP	A6NHQ4	379 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TPST2	O60704	377 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GPX5	O75715	221 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LYPD3	O95274	346 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CPN1	P15169	458 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	AZU1	P20160	251 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TPSB2	P20231	275 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	VDAC1	P21796	283 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	EPHX2	P34913	555 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR3A4P	P47883	348 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CUL1	Q13616	776 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	TPSAB1	Q15661	275 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SYPL1	Q16563	259 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	CFAP157	Q5JU67	520 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ATAD3B	Q5T9A4	648 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	OR5M10	Q6IEU7	315 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PTPRK-215	ENST00000498284	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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