RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493112.5

SUCLG2-204, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUCLG2, Length 1,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-204ENST00000493112 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ROBO4Q8WZ75 1007 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 OSTF1Q92882 214 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 NEURL3Q96EH8 262 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 INPP5KQ9BT40 448 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 COQ10BQ9H8M1 238 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 EXD2Q9NVH0 621 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 NDRG3Q9UGV2 375 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 BTNL2Q9UIR0 455 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 EMC9Q9Y3B6 208 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 GPR45Q9Y5Y3 372 aa11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 AKAP9Q99996 3911 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 SIAH2O43255 324 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CYP7B1O75881 506 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 GOSR1O95249 250 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 NID1P14543 1247 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CD1EP15812 388 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 AGTR1P30556 359 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PCYT1AP49585 367 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 SELENBP1Q13228 472 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ATAD3BQ5T9A4 648 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ATG16L1Q676U5 607 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 FRRS1Q6ZNA5 592 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 RNF130Q86XS8 419 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 RNF128Q8TEB7 428 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ZFP90Q8TF47 636 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ROPN1LQ96C74 230 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PANX1Q96RD7 426 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 SLC39A3Q9BRY0 314 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 WDR45Q9Y484 360 aa11.13□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CCDC154A6NI56 674 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 GJE1A6NN92 205 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 HMGN4O00479 90 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CASKO14936 926 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ATE1O95260 518 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 AGR2O95994 175 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CSTAP01040 98 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 GSNP06396 782 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PGRP06401 933 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 DNASE1P24855 282 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ADH6P28332 368 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PLAURQ03405 335 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CBFBQ13951 182 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 TIGD2Q4W5G0 525 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 SLC25A53Q5H9E4 307 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 NXNQ6DKJ4 435 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ABHD3Q8WU67 409 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 OR52E6Q96RD3 313 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ZBTB18Q99592 522 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 FOXC2Q99958 501 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 MED18Q9BUE0 208 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 LAT2Q9GZY6 243 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 C12orf49Q9H741 205 aa11.12□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 A0A1W2PNR3 127 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 DEFB108AA8MXU0 73 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 SLCO1B7G3V0H7 640 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 C16orf97H3BN30 126 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 DNAJA2O60884 412 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 H6PDO95479 791 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 RAF1P04049 648 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PGM1P36871 562 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CARD18P57730 90 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 HPCAP84074 193 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CHRNEQ04844 493 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 GPAT3Q53EU6 434 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ANKRD34AQ69YU3 496 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 C22orf34Q6ZV56 151 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ZNF619Q8N2I2 560 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ANKFN1Q8N957 763 aa11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SUCLG2-204ENST00000493112 ARL8AQ96BM9 186 aa11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms