RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OSGIN1Q9UJX0 560 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ACAD8Q9UKU7 415 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 NUP50Q9UKX7 468 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 WDR45Q9Y484 360 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 A0A0C4DFX4 3053 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SMIM30A4D0T7 59 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SH3D21A4FU49 640 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ARRDC5A6NEK1 342 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DSCR3O14972 297 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LRRTM2O43300 516 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IFNA16P05015 189 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GKN3PP0CG01 181 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ALOX12P18054 663 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TNFRSF17Q02223 184 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FIGNL1Q6PIW4 674 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ARSKQ6UWY0 536 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KIF18BQ86Y91 864 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 MORN4Q8NDC4 146 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SFXN5Q8TD22 340 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CD180Q99467 661 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KCNS3Q9BQ31 491 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GPR174Q9BXC1 333 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PINK1Q9BXM7 581 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KCMF1Q9P0J7 381 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DAPP1Q9UN19 280 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ALPK2Q86TB3 2170 aa6.5□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ISPDA4D126 451 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR2W5A6NFC9 320 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AP3D1O14617 1153 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FGF17O60258 216 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR2B6P58173 313 aa6.49□□□□□ -1.37
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HERC4-211ENST00000492996 MADCAM1Q13477 382 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IRF3Q14653 427 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DS3Q14952 304 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SPHARQ15513 63 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SSX1Q16384 188 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ENTPD8Q5MY95 495 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 C12orf73Q69YU5 71 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SPATC1Q76KD6 591 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PARGQ86W56 976 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AMER2Q8N7J2 671 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.37
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HERC4-211ENST00000492996 CRELD1Q96HD1 420 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FUZQ9BT04 418 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SARGQ9BW04 601 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 DIABLOQ9NR28 239 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KLHL28Q9NXS3 571 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 KLK13Q9UKR3 277 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 B4DGG1 531 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SGK494L7N484 410 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PIP5K1CO60331 668 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 GPX5O75715 221 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 HBQ1P09105 142 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 PRG2P13727 222 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 CTSEP14091 401 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 FUT1P19526 365 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TGM4P49221 684 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 SYT14P1Q58G82 188 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 ZNF544Q6NX49 715 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 TSSK4Q6SA08 328 aa6.49□□□□□ -1.37
HERC4-211ENST00000492996 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.49□□□□□ -1.37
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