RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 FPR1P21462 350 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 PEX2P28328 305 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 TRAM2Q15035 370 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 DCST1Q5T197 706 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 WBP2NLQ6ICG8 309 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 GDF7Q7Z4P5 450 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 SVOPLQ8N434 492 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 LSMEM1Q8N8F7 131 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 ALPK1Q96QP1 1244 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 C9orf16Q9BUW7 83 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 RNF32Q9H0A6 362 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 FRYQ5TBA9 3013 aa20.09■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1B0GWA3 101 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 CEACAM4O75871 244 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 CNR1P21554 472 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 DNASE1L1P49184 302 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 GPR85P60893 370 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 KCNAB2Q13303 367 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 LAPTM4AQ15012 233 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 ALG10BQ5I7T1 473 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 BORAQ6PGQ7 559 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 STK32CQ86UX6 486 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 HIPK1Q86Z02 1210 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 OR1J4Q8NGS1 313 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 NRG4Q8WWG1 115 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 PROK2Q9HC23 129 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 KLHL1Q9NR64 748 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 ZFHX4Q86UP3 3567 aa20.08■□□□□ 0.81
PSPC1-204ENST00000492741 ACACAQ13085 2346 aa20.08■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PRQ8 180 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 ANKUB1A6NFN9 424 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 PDLIM1O00151 329 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 GP1BBP13224 206 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 CD46P15529 392 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 FUT4P22083 530 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 DGCR6Q14129 220 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 ULK3Q6PHR2 472 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 RRM2BQ7LG56 351 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 WDSUB1Q8N9V3 476 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 GPR119Q8TDV5 335 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 SLC38A4Q969I6 547 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 C5orf34Q96MH7 638 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 FRMD6Q96NE9 622 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 KLHDC3Q9BQ90 382 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 VCX3BQ9H321 246 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 TAS2R10Q9NYW0 307 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 CEP295Q9C0D2 2601 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 THRBP10828 461 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 HMGA2P52926 109 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 QPRTQ15274 297 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 CATSPER1Q8NEC5 780 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 A0A0B4J2E0 115 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1B0GX12 115 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 FAAHO00519 579 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 SNPHO15079 494 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 CCNB2O95067 398 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 THY1P04216 161 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 PRKACGP22612 351 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 SLC1A3P43003 542 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 CXADRP78310 365 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 GK3PQ14409 553 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 SLC25A25Q6KCM7 469 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 NKAIN4Q8IVV8 208 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 OR2M3Q8NG83 312 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 GIPC3Q8TF64 312 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM234Q8WY98 164 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 NRBF2Q96F24 287 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF597Q96LX8 424 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 GNRHR2Q96P88 292 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 HES7Q9BYE0 225 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 KLHL4Q9C0H6 718 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 VCXQ9H320 206 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 COQ10BQ9H8M1 238 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 FBXL2Q9UKC9 423 aa20.06■□□□□ 0.8
PSPC1-204ENST00000492741 VDAC3Q9Y277 283 aa20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms