RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491153.1

KDM5B-208, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5B, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-208ENST00000491153 FOXF1Q12946 379 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SELENBP1Q13228 472 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 GNA13Q14344 377 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 QPRTQ15274 297 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TESK1Q15569 626 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TTMPQ5BVD1 217 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 FRRS1Q6ZNA5 592 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 LUZP2Q86TE4 346 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 RNF130Q86XS8 419 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SLC43A2Q8N370 569 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF614Q8N883 585 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ZFP90Q8TF47 636 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SMPDL3BQ92485 455 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 RAB8BQ92930 207 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ITCHQ96J02 903 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 NPAS1Q99742 590 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 INPP5KQ9BT40 448 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 OR10A4Q9H209 315 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SERINC1Q9NRX5 453 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ACER3Q9NUN7 267 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CALML5Q9NZT1 146 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PROCRQ9UNN8 238 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.01□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PDZD2O15018 2839 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 LRBAP50851 2863 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 HCFC1P51610 2035 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ABCA12Q86UK0 2595 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SH3D21A4FU49 640 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 NPIPA7E9PJI5 369 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 C16orf97H3BN30 126 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TNFSF11O14788 317 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CASKO14936 926 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 DNPH1O43598 174 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CXCL13O43927 109 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PRKD3O94806 890 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 H6PDO95479 791 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ANP32DO95626 131 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 DBIP07108 87 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TFPTP0C1Z6 253 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 NPIPA8P0DM63 369 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 UGT2B10P36537 528 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CDKN2CP42773 168 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 HTR3AP46098 478 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 IDH3AP50213 366 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ATP4BP51164 291 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CTBP2P56545 445 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SESN3P58005 492 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 RAC3P60763 192 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 STX1BP61266 288 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PPP2R2AP63151 447 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CHRNEQ04844 493 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 MAPK14Q16539 360 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 TIGD2Q4W5G0 525 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 GPAT3Q53EU6 434 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 C3orf33Q6P1S2 294 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 VWA1Q6PCB0 445 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 PLXDC2Q6UX71 529 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 BEND4Q6ZU67 534 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 STK32CQ86UX6 486 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF440Q8IYI8 595 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ZNF610Q8N9Z0 462 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 RNF128Q8TEB7 428 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 DYDC1Q8WWB3 177 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CKAP2Q8WWK9 683 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 GTF2H4Q92759 462 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 ZG16BQ96DA0 208 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 MAGEB18Q96M61 343 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 SIKE1Q9BRV8 207 aa7□□□□□ -1.29
KDM5B-208ENST00000491153 CCDC106Q9BWC9 280 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms