RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489835.6

PRRT4-205, Transcript of proline rich transmembrane protein 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4-205ENST00000489835 PLA2G2CQ5R387 149 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 KLHL17Q6TDP4 642 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 NPSR1Q6W5P4 371 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PEX5LQ8IYB4 626 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 VSTM2LQ96N03 204 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF350Q9GZX5 532 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SLC13A4Q9UKG4 626 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa15.99■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 IGKV1D-16P01601 117 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 QSOX2Q6ZRP7 698 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 C17orf50Q8WW18 174 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 TAPBPLQ9BX59 468 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 KIF26BQ2KJY2 2108 aa15.98■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 RGS5O15539 181 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CYP7B1O75881 506 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CLPSP04118 112 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 POU1F1P28069 291 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SEC23BQ15437 767 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 LCN10Q6JVE6 187 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF836Q6ZNA1 936 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 LANCL3Q6ZV70 420 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PPP1R3BQ86XI6 285 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF619Q8N2I2 560 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SETD6Q8TBK2 473 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 LOXL4Q96JB6 756 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SNX18Q96RF0 628 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 KCND3Q9UK17 655 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PRAMEF2O60811 474 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 NTN1O95631 604 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CT45A8P0DMV1 189 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CT45A9P0DMV2 189 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PIPP12273 146 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CCL4P13236 92 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZFP69Q49AA0 526 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CT45A2Q5DJT8 189 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 DBX2Q6ZNG2 339 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZNF614Q8N883 585 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 STT3BQ8TCJ2 826 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 OPALINQ96PE5 141 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 LMF1Q96S06 567 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ASPNQ9BXN1 380 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SATB2Q9UPW6 733 aa15.97■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 BRINP1O60477 761 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 H1F0P07305 194 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 FNDC11Q9BVV2 318 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 A8MV72 311 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 UGT2B17O75795 530 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 IFI6P09912 130 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 GKN3PP0CG01 181 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PRKAR1BP31321 381 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 CLDN6P56747 220 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ARMC4Q5T2S8 1044 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ASB15Q8WXK1 588 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PMEPA1Q969W9 287 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ST6GAL2Q96JF0 529 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PHOX2BQ99453 314 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 ARHGDIGQ99819 225 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 BARHL1Q9BZE3 327 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 SAP130Q9H0E3 1048 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 HHATLQ9HCP6 504 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 TMCC3Q9ULS5 477 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa15.96■□□□□ 0.15
PRRT4-205ENST00000489835 V9GYH0 126 aa15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms