RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 GINS1Q14691 196 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GPR19Q15760 415 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SNAPC1Q16533 368 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TBRG1Q3YBR2 411 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF628Q5EBL2 1059 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PODNL1Q6PEZ8 512 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR4N5Q8IXE1 308 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TCTE3Q8IZS6 198 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR2L13Q8N349 312 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OSTF1Q92882 214 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MVB12AQ96EY5 273 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 JAM3Q9BX67 310 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR51I1Q9H343 314 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GIMAP4Q9NUV9 329 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL28Q9NXS3 571 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 LIPT1Q9Y234 373 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CHD6Q8TD26 2715 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SDK1Q7Z5N4 2213 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ARHGEF9O43307 516 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF749O43361 778 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SCO2O43819 266 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PLOD3O60568 738 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ONECUT2O95948 504 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 AGR2O95994 175 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-DPB1P04440 258 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 FHP07954 510 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ADRA2AP08913 450 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SLC35E2P0CK97 266 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF24P17028 368 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 S1PR1P21453 382 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 STAT5AP42229 794 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MAP2K3P46734 347 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MTNR1AP48039 350 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GIPRP48546 466 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SKP1P63208 163 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PRR5P85299 388 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SHC2P98077 582 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 BDH1Q02338 343 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 MAP4K2Q12851 820 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 TRAM2Q15035 370 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CARTPTQ16568 116 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GPAT3Q53EU6 434 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PYDC2Q56P42 97 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SLITRK4Q8IW52 837 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF595Q8IYB9 648 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PSD4Q8NDX1 1056 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR7G2Q8NG99 324 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR9A2Q8NGT5 310 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 OR52N1Q8NH53 320 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PIGXQ8TBF5 258 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SLC7A6Q92536 515 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 RNFT2Q96EX2 444 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 GON7Q9BXV9 100 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 NIPAL2Q9H841 368 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 RNF121Q9H920 327 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ABCB9Q9NP78 766 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 DIABLOQ9NR28 239 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 CUTCQ9NTM9 273 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 ASB6Q9NWX5 421 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 SOHLH2Q9NX45 425 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-208ENST00000486964 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms