RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472032.1

BBX-222, Transcript of BBX, HMG-box containing, human

TSL 4

Gene BBX, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBX-222	ENST00000472032	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SPATA2	Q9UM82	520 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MPDZ	O75970	2070 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		3.78	□□□□□ -1.8
BBX-222	ENST00000472032	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SCN2A	Q99250	2005 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032		A0A1B0GTQ1	180 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032		A0A1W2PRB8	838 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ARL5C	A6NH57	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032		A6NLC8	198 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032		H7C2Y5	167 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032		J3QRE1	110 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ZNF749	O43361	778 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	TSPAN3	O60637	253 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	TBX19	O60806	448 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	PRAMEF2	O60811	474 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SDC3	O75056	442 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	FZD7	O75084	574 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	TOX	O94900	526 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	PRAMEF12	O95522	483 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	OLFM2	O95897	454 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CD160	O95971	181 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	PLAT	P00750	562 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	APOC3	P02656	99 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	MT-ND4	P03905	459 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	WNT1	P04628	370 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	AMY2A	P04746	511 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	HIST1H2AB	P04908	130 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	S100A6	P06703	90 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	RHOC	P08134	193 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CD3G	P09693	182 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	UBB	P0CG47	229 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SMIM6	P0DI80	62 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	EPX	P11678	715 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CEL	P19835	753 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	AMY2B	P19961	511 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	HTR1F	P30939	366 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	HOXC8	P31273	242 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SOAT1	P35610	550 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SERPINF1	P36955	418 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SPAM1	P38567	509 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	RFC3	P40938	356 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	BCL6	P41182	706 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CSK	P41240	450 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	NSG1	P42857	185 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CCR6	P51684	374 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CCR9	P51686	369 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CDH11	P55287	796 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	KIAA1024L	P59773	190 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	RAB8A	P61006	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	AP1S1	P61966	158 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ARF5	P84085	180 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ROM1	Q03395	351 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	BCL2L1	Q07817	233 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	PLD1	Q13393	1074 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	FZD5	Q13467	585 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	HTR4	Q13639	388 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	DOC2A	Q14183	400 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	KRT33B	Q14525	404 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	INSL4	Q14641	139 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	NR0B2	Q15466	257 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CHRNA6	Q15825	494 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CDKN3	Q16667	212 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SLC5A12	Q1EHB4	618 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ZNF791	Q3KP31	576 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	SYTL3	Q4VX76	610 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CT83	Q5H943	113 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ZNF626	Q68DY1	528 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	CDC73	Q6P1J9	531 aa		3.77	□□□□□ -1.81
BBX-222	ENST00000472032	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		3.77	□□□□□ -1.81

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