RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 STARD4Q96DR4 205 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SPDL1Q96EA4 605 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DNAJA3Q96EY1 480 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBTB18Q99592 522 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGQQ9BRB3 760 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PINK1Q9BXM7 581 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXD1Q9GZZ0 328 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PTGES2Q9H7Z7 377 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TPT1P8Q9HAU6 139 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NPHS2Q9NP85 383 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CHST11Q9NPF2 352 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ16Q9NPI9 418 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC4AQ9UMR7 237 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR45Q9Y484 360 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WZY1 265 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PNR3 127 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PNV4 684 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf72A4D263 438 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CLIC1O00299 241 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NR5A2O00482 541 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FBP2O00757 339 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF264O43296 627 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CXCL13O43927 109 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CYP7B1O75881 506 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 AK1P00568 194 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CGAP01215 116 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GUSBP08236 651 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TFPTP0C1Z6 253 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 UBL4AP11441 157 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 COX6B1P14854 86 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 HPGDP15428 266 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF17P17021 662 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SFTPDP35247 375 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP4BP51164 291 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SESN3P58005 492 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RAC1P63000 192 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SIRPAP78324 504 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNJ10P78508 379 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RCAN2Q14206 197 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 PON3Q15166 354 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 QPRTQ15274 297 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RGNQ15493 299 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 LUZP2Q86TE4 346 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MISPQ8IVT2 679 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 CLIP4Q8N3C7 705 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5W2Q8NH69 310 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10D3Q8NH80 312 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01560Q8TB33 94 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 MAL2Q969L2 176 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ITCHQ96J02 903 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 EXD2Q9NVH0 621 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 RLIMQ9NVW2 624 aa6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RABGEF1-206ENST00000461017 DSPPQ9NZW4 1301 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 DSCAMO60469 2012 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A096LPI6 279 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JND7 137 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 AGAP5A6NIR3 686 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A20A6NK97 555 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MXE2 369 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 J3QL48 77 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMDEC1O15204 470 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SIAH2O43255 324 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 SOX30O94993 753 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 KRT75O95678 551 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT14O95848 222 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 IL18BPO95998 194 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 CSTAP01040 98 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 BCHEP06276 602 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 GKN3PP0CG01 181 aa6.27□□□□□ -1.41
RABGEF1-206ENST00000461017 NR2F1P10589 423 aa6.27□□□□□ -1.41
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