RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	STAB1	Q9NY15	2570 aa		15.83	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		15.83	■□□□□ 0.13
MRPL28-203	ENST00000429738	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF195	O14628	629 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF264	O43296	627 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJA2	O60884	412 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNGR4	O95473	234 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBB	P07437	444 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	LBP	P18428	481 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SFTPD	P35247	375 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNJ5	P48544	419 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CTBP2	P56545	445 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CARD18	P57730	90 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	BST1	Q10588	318 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	STX3	Q13277	289 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	OGFOD2	Q6N063	350 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF550	Q7Z398	422 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CROCCP2	Q86T23	111 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5W2	Q8NH69	310 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF128	Q8TEB7	428 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	NUF2	Q9BZD4	464 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPH	Q9H3R5	247 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		15.83	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SERINC4	A6NH21	518 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	FCMR	O60667	390 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	STX11	O75558	287 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	UGT2B17	O75795	530 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT14	O95848	222 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	GUSB	P08236	651 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	UBL4A	P11441	157 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	UQCRC2	P22695	453 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	AGTR1	P30556	359 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CASP8	Q14790	479 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SAXO2	Q658L1	398 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD46	Q86W74	232 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF614	Q8N883	585 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4A15	Q8NGL6	344 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51I1	Q9H343	314 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	PNPO	Q9NVS9	261 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		15.82	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	GJE1	A6NN92	205 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	FPR1	P21462	350 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP2R2B	Q00005	443 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SELENBP1	Q13228	472 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SKP2	Q13309	424 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	CBFB	Q13951	182 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR68	Q15743	365 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ACKR1	Q16570	336 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP90	Q8TF47	636 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	NEURL3	Q96EH8	262 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TEX37	Q96LM6	180 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	LAT2	Q9GZY6	243 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	EXD2	Q9NVH0	621 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	INAFM1	C9JVW0	142 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738		E9PBE3	544 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SDHD	O14521	159 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA0513	O60268	411 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	AGR2	O95994	175 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	THBD	P07204	575 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	PABPC4L	P0CB38	370 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP3CB	P16298	524 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	FUT5	Q11128	374 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	QPRT	Q15274	297 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	TYW3	Q6IPR3	259 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	BEND4	Q6ZU67	534 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MRPL28-203	ENST00000429738	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		15.8	■□□□□ 0.12

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