RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 PCCBP05166 539 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRTM4Q86VH4 590 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GJD3Q8N144 294 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ACOT4Q8N9L9 421 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF527Q8NB42 609 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 UXS1Q8NBZ7 420 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 NUP43Q8NFH3 380 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR56A1Q8NGH5 318 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR56B4Q8NH76 319 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SFXN5Q8TD22 340 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 NR4A3Q92570 626 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 KAT2AQ92830 837 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PMEPA1Q969W9 287 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC41A3Q96GZ6 507 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MCHR1Q99705 422 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTR6Q9GZN1 396 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TRIM36Q9NQ86 728 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNMB2Q9Y691 235 aa17.02■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 E9PI62 339 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 LATO43561 262 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PPM1BO75688 479 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 WNT1P04628 370 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGN1P05114 100 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 IL32P24001 234 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 BLVRAP53004 296 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN2P57739 230 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PRR5P85299 388 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 BTN1A1Q13410 526 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 LTB4RQ15722 352 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 DECR1Q16698 335 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ZSWIM7Q19AV6 140 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SFTPA1Q8IWL2 248 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR51Q1Q8NH59 317 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ABHD4Q8TB40 342 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 COX14Q96I36 57 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 HCAR1Q9BXC0 346 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 UBQLN3Q9H347 655 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 POMT2Q9UKY4 750 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC7A7Q9UM01 511 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC35G4P0C7Q5 338 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ADH5P11766 374 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 NDUFV2P19404 249 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 DRD5P21918 477 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PAICSP22234 425 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CERS1P27544 350 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 HSD17B2P37059 387 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PDX1P52945 283 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PITPNAQ00169 270 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OPCMLQ14982 345 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 C7orf57Q8NEG2 295 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR2A1Q8NGT9 310 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR8D1Q8WZ84 308 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL1Q9NR64 748 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 HCN3Q9P1Z3 774 aa17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 DOCK9Q9BZ29 2069 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 DAPL1A0PJW8 107 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ANTXRLA6NF34 631 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TRABD2BA6NFA1 517 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRN3E7EW58 273 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ZGLP1P0C6A0 271 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 EPHA4P54764 986 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TSPAN5P62079 268 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 E2F1Q01094 437 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC3A1Q07837 685 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 NHLRC3Q5JS37 347 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM78AQ5JUQ0 283 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC22A10Q63ZE4 541 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 GID4Q8IVV7 300 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 RIT1Q92963 219 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OTUB2Q96DC9 234 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MS4A6EQ96DS6 147 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 FERD3LQ96RJ6 166 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRN3Q9H3W5 708 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 ANKRD19PQ9H560 264 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 SDHAF2Q9NX18 166 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6C2Q9NZP2 312 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 MFSD2BA6NFX1 497 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 EMC8O43402 210 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 CD53P19397 219 aa17■□□□□ 0.31
RALGPS1-208ENST00000424082 TRAM1Q15629 374 aa17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms