RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423693.5

HDLBP-210, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-210ENST00000423693 CYP7B1O75881 506 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 AGFG2O95081 481 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 NTN1O95631 604 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF708P17019 499 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 PRKCAP17252 672 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 HTR3AP46098 478 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CCR4P51679 360 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CLDN18P56856 261 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RAC1P63000 192 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 QPRTQ15274 297 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF836Q6ZNA1 936 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CCDC80Q76M96 950 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF550Q7Z398 422 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 FJX1Q86VR8 437 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 VRK2Q86Y07 508 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SLC15A3Q8IY34 581 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ULK2Q8IYT8 1036 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 MEIOBQ8N635 442 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 FITM2Q8N6M3 262 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 OR5M9Q8NGP3 310 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 UCN2Q96RP3 112 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 DMRTA2Q96SC8 542 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 TRIM8Q9BZR9 551 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CALHM2Q9HA72 323 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ACER3Q9NUN7 267 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 FREM3P0C091 2139 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CD8B2A6NJW9 211 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CLDN24A6NM45 220 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 GJE1A6NN92 205 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 FAM220BPB1ANY3 271 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 M0QX08 132 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 MFN2O95140 757 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 EPPINO95925 133 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 IFNA14P01570 189 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 C8BP07358 591 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 AGAP20933 346 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ME2P23368 584 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 STARP49675 285 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 MAP2K6P52564 334 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 PSME3P61289 254 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 PLAURQ03405 335 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 NDUFAF6Q330K2 333 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 DCST1Q5T197 706 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 C1orf185Q5T7R7 199 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RPTNQ6XPR3 784 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 GRINAQ7Z429 371 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 HMGN2P46Q86SG4 172 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ARMC8Q8IUR7 673 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 OR2T12Q8NG77 320 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 FBXO27Q8NI29 283 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ZNF563Q8TA94 476 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 POC1BQ8TC44 478 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RNF145Q96MT1 663 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 PINK1Q9BXM7 581 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ARL8BQ9NVJ2 186 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RLIMQ9NVW2 624 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CMTM6Q9NX76 183 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ALKBH4Q9NXW9 302 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CAMK2AQ9UQM7 478 aa11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 FASNP49327 2511 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 H0Y3Z8 333 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SYT5O00445 386 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 LDLRP01130 860 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 GP1BBP13224 206 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 AQP1P29972 269 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RYKP34925 604 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 TIMP3P35625 211 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SLC1A3P43003 542 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SLC7A2P52569 658 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SMSP52788 366 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SESN3P58005 492 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 COPZ1P61923 177 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 LIPEQ05469 1076 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 EPS8Q12929 822 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 FOXF1Q12946 379 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SELENBP1Q13228 472 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 SPATS1Q496A3 300 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 RTL6Q6ICC9 239 aa11.68□□□□□ -0.54
HDLBP-210ENST00000423693 CHMP1BQ7LBR1 199 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms