RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB134Q4QY38 66 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 THSD4Q6ZMP0 1018 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KRT74Q7RTS7 529 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 IFT27Q9BW83 186 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAP2Q9NPF8 381 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO34Q9NWN3 711 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAPPC13A5PLN9 417 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC6A1P30531 599 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OR1Q1Q15612 314 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL2L15Q5TBC7 163 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SFXN4Q6P4A7 337 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RPTNQ6XPR3 784 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CEACAM19Q7Z692 300 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR135Q8IZ08 494 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM239Q8WW34 195 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LCN9Q8WX39 176 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 GAL3ST3Q96A11 431 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CLEC4AQ9UMR7 237 aa17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CLUP10909 449 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 THBS2P35442 1172 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 IGFALSP35858 605 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ACVR1BP36896 505 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SRP9P49458 86 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF17Q02223 184 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 GALEQ14376 348 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SHISA5Q8N114 240 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OR4K14Q8NGD5 310 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OR13C2Q8NGS9 318 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGB4Q8WW32 186 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PTP4A1Q93096 173 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM74BQ9NUR3 256 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV6A0A075B6T7 132 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0A6YYJ9 748 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 J3QLW9 94 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX12O00623 359 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF19P17023 458 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NOS3P29474 1203 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RGS1Q08116 209 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMK2BQ13554 666 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ENPP2Q13822 863 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 EIPR1Q53HC9 387 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM205BPQ63HN1 556 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC44A3Q8N4M1 653 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 CYB561A3Q8NBI2 242 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 C17orf47Q8NEP4 570 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PHF21AQ96BD5 680 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SIPA1Q96FS4 1042 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 EML2O95834 649 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 AGR2O95994 175 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SAGP10523 405 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 F8A1P23610 371 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PITPNBP48739 271 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 DUSP8Q13202 625 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ASPGQ86U10 573 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OAFQ86UD1 273 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 AMIGO1Q86WK6 493 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2L13Q8N349 312 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD1Q96SE0 405 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TEAD3Q99594 435 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NDC1Q9BTX1 674 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC17A9Q9BYT1 436 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TTTY10Q9BZA0 68 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FN3KQ9H479 309 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXL4Q9UKA2 621 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV27A0A087WT01 109 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF860A6NHJ4 632 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TNFRSF10AO00220 468 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 ADH1BP00325 375 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 MT-ND5P03915 603 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXK2Q01167 660 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA1AQ53H76 456 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 SDE2Q6IQ49 451 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 PAQR7Q86WK9 346 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEFF1Q8IYR6 380 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 OR51A7Q8NH64 312 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 C4orf36Q96KX1 117 aa17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM86C2PA6NEL3 165 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms