RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 ADIPOR1Q96A54 375 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 VMP1Q96GC9 406 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 MPP4Q96JB8 637 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 Q96MT0 163 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PRRG3Q9BZD7 231 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 RASSF1Q9NS23 344 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NCDNQ9UBB6 729 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.1□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 A0A0B4J2E0 115 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1B0GWA3 101 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1B0GX12 115 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SH3D21A4FU49 640 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 UNC119BA6NIH7 251 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 C4orf47A7E2U8 309 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PTGES3LE9PB15 166 aa6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 LRP3O75074 770 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CBFA2T3O75081 653 aa6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 SOX14O95416 240 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 IGHEP01854 428 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NGFRP08138 427 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 LINGO3P0C6S8 592 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 UBL4AP11441 157 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CDK4P11802 303 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF28P17035 718 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 HTR2AP28223 471 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 FMO3P31513 532 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TTKP33981 857 aa6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 SLC6A8P48029 635 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ALDH3B2P48448 385 aa6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 PNLIPRP2P54317 469 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PRKCDQ05655 676 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 NADK2Q4G0N4 442 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 GPR141Q7Z602 305 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SATL1Q86VE3 508 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 NRMQ8IXM6 262 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PRR22Q8IZ63 422 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CADM2Q8N3J6 435 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SUMF1Q8NBK3 374 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 GRHL3Q8TE85 626 aa6.09□□□□□ -1.43
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HDAC8-211ENST00000415409 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 CLN6Q9NWW5 311 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 MED31Q9Y3C7 131 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC8-211ENST00000415409 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
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