RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384281.1

SNORA54-201, Transcript of small nucleolar RNA, H/ACA box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORA54, Length 123 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORA54-201ENST00000384281 M0R3H8 397 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 ACOT7O00154 380 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 CLIC1O00299 241 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 FAAHO00519 579 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 MRASO14807 208 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 FFAR1O14842 300 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 CFLARO15519 480 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 PRSS23O95084 383 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 ART1P52961 327 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 NRG3P56975 720 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 H3F3AP84243 136 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 EPS8Q12929 822 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 FADDQ13158 208 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 QPRTQ15274 297 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 GPR68Q15743 365 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 NRF1Q16656 503 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 C1orf185Q5T7R7 199 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 ANXA8L1Q5VT79 327 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa2.75□□□□□ -1.97
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SNORA54-201ENST00000384281 NATD1Q8N6N6 113 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 C7orf57Q8NEG2 295 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 OR1J4Q8NGS1 313 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 OR5W2Q8NH69 310 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 FNDC9Q8TBE3 224 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 DUSP19Q8WTR2 217 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 TSPEARQ8WU66 669 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 C3orf49Q96BT1 292 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 MOAP1Q96BY2 351 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 ITCHQ96J02 903 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 ARL5BQ96KC2 179 aa2.75□□□□□ -1.97
SNORA54-201ENST00000384281 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
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