RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365367.1

RNU6-53P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 53, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-53P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAP2K6P52564 334 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 FOXA1P55317 472 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 DLX1P56177 255 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 RAB38P57729 211 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 DYNLT1P63172 113 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 TUBA1BP68363 451 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 BTN3A2P78410 334 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 CRADDP78560 199 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 REEP5Q00765 189 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 HMGCS1Q01581 520 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ACVR1Q04771 509 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 CDH17Q12864 832 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC13A2Q13183 592 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 RCAN2Q14206 197 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ITIH4Q14624 930 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 POU6F1Q14863 301 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 PPA1Q15181 289 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 RPS6KA2Q15349 733 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 TOMM20Q15388 145 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 STK11Q15831 433 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 GABRA6Q16445 453 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 KLHL38Q2WGJ6 581 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ODF3L2Q3SX64 289 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 DEFB121Q5J5C9 76 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 PLAC9Q5JTB6 97 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 FRG2Q64ET8 278 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 UGT3A1Q6NUS8 523 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM180BQ6P0A1 224 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 C16orf87Q6PH81 154 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 DCUN1D2Q6PH85 259 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 OPN5Q6U736 354 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 CES3Q6UWW8 571 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 MFSD7Q6UXD7 560 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 RAPH1Q70E73 1250 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 TUBA1AQ71U36 451 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 LINGO2Q7L985 606 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 TAS2R42Q7RTR8 314 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 P4HA3Q7Z4N8 544 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ADCK2Q7Z695 626 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 IFNEQ86WN2 208 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 SBSPONQ8IVN8 264 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 WDFY1Q8IWB7 410 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF786Q8N393 782 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 BBS5Q8N3I7 341 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 GALNT4Q8N4A0 578 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 BPIFB2Q8N4F0 458 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 METTL25Q8N6Q8 603 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 NIPA2Q8N8Q9 360 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 SYT14Q8NB59 555 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 MORN4Q8NDC4 146 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ABHD11Q8NFV4 315 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR1J4Q8NGS1 313 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR9A1PQ8NGU1 263 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR6K3Q8NGY3 331 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR8K3Q8NH51 312 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR10D3Q8NH80 312 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR14L1PQ8NHC6 308 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 PPP1R35Q8TAP8 253 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 NUBPLQ8TB37 319 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 KCTD4Q8WVF5 259 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC13A3Q8WWT9 602 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 SGCDQ92629 289 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 NEIL2Q969S2 332 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC22A18Q96BI1 424 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 HAUS1Q96CS2 278 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 MS4A6EQ96DS6 147 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 DNAJA3Q96EY1 480 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 DCUN1D1Q96GG9 259 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 RUNDC3BQ96NL0 473 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 GSDMAQ96QA5 445 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 TSPAN32Q96QS1 320 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 GAL3ST4Q96RP7 486 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRR25Q96S07 402 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 KRT12Q99456 494 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 TSG101Q99816 390 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 NABP2Q9BQ15 211 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 INPP5KQ9BT40 448 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 PTDSS2Q9BVG9 487 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 CARD6Q9BX69 1037 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 SUCNR1Q9BXA5 334 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 ITPAQ9BY32 194 aa1.05□□□□□ -2.24
RNU6-53P-201ENST00000365367 POTEKPQ9BYX7 375 aa1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms