RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CALHM2Q9HA72 323 aa1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 SH2D2AQ9NP31 389 aa1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 DCDC2Q9UHG0 476 aa1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLLPQ9Y342 182 aa1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 OARD1Q9Y530 152 aa1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDH10Q9Y6N8 788 aa1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPACA6W5XKT8 324 aa1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP1.61□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 RLFQ13129 1914 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1B0GUA9 196 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 F8WDY8 70 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 SULT2B1O00204 365 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHADO15335 359 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPIPB7O75200 414 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBD3O95983 291 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV3-11P04433 115 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 HTR1EP28566 365 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCND2P30279 289 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 NMT1P30419 496 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP10-1P60331 282 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 GMFBP60983 142 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB40BQ12829 278 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CUL1Q13616 776 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 MPPED2Q15777 294 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 PARP10Q53GL7 1025 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBLN3Q6UW01 205 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 UNC5DQ6UXZ4 953 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARMCX2Q7L311 632 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM17Q86X19 198 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 C15orf54Q8N8G6 183 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF740Q8NDX6 193 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR8H1Q8NGG4 311 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 NEIL3Q8TAT5 605 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 RDH5Q92781 318 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 AKR1E2Q96JD6 320 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBOAT4Q96T53 435 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRTNQ99748 197 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 FICDQ9BVA6 458 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSDMCQ9BYG8 508 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT23Q9C075 422 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAGT1Q9H0U3 335 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf21Q9H246 121 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 APMAPQ9HDC9 416 aa1.6□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0G2JRQ6 117 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1B0GUL7 405 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 A8MUA0 341 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 HCN1O60741 890 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 ECI2O75521 394 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLITRK3O94933 977 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 TOP1P11387 765 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPSB2P20231 275 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP2B6P20813 491 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF5BP33176 963 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD80P33681 288 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDT1P36639 197 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 DLSTP36957 453 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS10P46783 165 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL1RL1Q01638 556 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC10A7Q0GE19 358 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDZK1IP1Q13113 114 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPSAB1Q15661 275 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 AGBL2Q5U5Z8 902 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRC8BQ6P9F7 803 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNSTQ6PJW8 725 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGFL3Q6UXB1 125 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 DPY19L4Q7Z388 723 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 VRK2Q86Y07 508 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRMQ8IXM6 262 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR51G2Q8NGK0 314 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC6A7Q99884 636 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHDC3Q9BQ90 382 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 MMP26Q9NRE1 261 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLK12Q9UKR0 248 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 CACNG2Q9Y698 323 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa1.59□□□□□ -2.15
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa1.59□□□□□ -2.16
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa1.59□□□□□ -2.16
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-227P-201ENST00000362865 VSTM2BA6NLU5 285 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-227P-201ENST00000362865 RSPH10B2B2RC85 870 aa1.58□□□□□ -2.16
RNU6-227P-201ENST00000362865 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms