RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 LCN1P31025 176 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD8-201ENST00000313173 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.54
HOXD8-201ENST00000313173 PHF19Q5T6S3 580 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD8-201ENST00000313173 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00114Q6XXX2 140 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD8-201ENST00000313173 WWTR1Q9GZV5 400 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD8-201ENST00000313173 HHATLQ9HCP6 504 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD8-201ENST00000313173 GPR52Q9Y2T5 361 aa24.65■■□□□ 1.54
HOXD8-201ENST00000313173 SCDO00767 359 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 TO15178 435 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 ONECUT2O95948 504 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 HMGN1P05114 100 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 HPGDP15428 266 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 DCDP81605 110 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 RNLSQ5VYX0 342 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 SLC29A4Q7RTT9 530 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 OR52L1Q8NGH7 329 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHA8Q96JA3 519 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 UBQLN3Q9H347 655 aa24.64■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 MLLT10P55197 1068 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 FXYD6P3P58550 94 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 HSDL2Q6YN16 418 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R3BQ86XI6 285 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 ANKK1Q8NFD2 765 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 PHOX2BQ99453 314 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 EFCAB9A8MZ26 197 aa24.63■■□□□ 1.53
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HOXD8-201ENST00000313173 RFPL3O75679 317 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 RCBTB2O95199 551 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 CH25HO95992 272 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 FUT1P19526 365 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 TBXA2RP21731 343 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 CD226Q15762 336 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM44Q2T9K0 475 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 PRR23CQ6ZRP0 262 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 SMOC1Q9H4F8 434 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 IL20RAQ9UHF4 553 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 UBL4AP11441 157 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 GPR143P51810 404 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 COPZ1P61923 177 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 FAAH2Q6GMR7 532 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 OR13C2Q8NGS9 318 aa24.62■■□□□ 1.53
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HOXD8-201ENST00000313173 ADOQ96SZ5 270 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 NRSN2Q9GZP1 204 aa24.62■■□□□ 1.53
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HOXD8-201ENST00000313173 KMT2EQ8IZD2 1858 aa24.62■■□□□ 1.53
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HOXD8-201ENST00000313173 SAGP10523 405 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
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HOXD8-201ENST00000313173 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 FOXL2P58012 376 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 SKP2Q13309 424 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 KLHL22Q53GT1 634 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 ARMCX4Q5H9R4 360 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 PRR22Q8IZ63 422 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF441Q8N8Z8 693 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 GATSQ8NAP1 163 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 OR52I1Q8NGK6 324 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 OR5M11Q96RB7 305 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 OCIAD1Q9NX40 245 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 ERGIC3Q9Y282 383 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 R4GN57 208 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 IDSB3KWA1 339 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 REM1O75628 298 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 BMP7P18075 431 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 IL12BP29460 328 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 OVCH1Q7RTY7 1134 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD37Q7Z713 158 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 C17orf47Q8NEP4 570 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 APMAPQ9HDC9 416 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 BHLHE40O14503 412 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 TSPAN2O60636 221 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 HCN1O60741 890 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 RAB36O95755 333 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 GAS1P54826 345 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 MED22Q15528 200 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 AADACL4Q5VUY2 407 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 SMARCD3Q6STE5 483 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 APOOLQ6UXV4 268 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 SLC34A3Q8N130 599 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXD8-201ENST00000313173 LGALS12Q96DT0 336 aa24.6■■□□□ 1.53
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