RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308521.9

APOBEC3F-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 2,694 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-201ENST00000308521 GNB5O14775 395 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 INPP1P49441 399 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 CSNK1G2P78368 415 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 HSF2Q03933 536 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 LRRC32Q14392 662 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 KRT78Q8N1N4 520 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 AMER3Q8N944 861 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 SLC37A3Q8NCC5 494 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 OR10G6Q8NH81 332 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ACOT12Q8WYK0 555 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 AIF1LQ9BQI0 150 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ASB6Q9NWX5 421 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 C5AR2Q9P296 337 aa9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 CIB4A0PJX0 185 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 HMGN4O00479 90 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 APOL3O95236 402 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 HLA-DPB1P04440 258 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 LIMS3P0CW19 117 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 LIMS4P0CW20 117 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 C4BPBP20851 252 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 MTNR1AP48039 350 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 CAV3P56539 151 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 PRRT3Q5FWE3 981 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 RAB42Q8N4Z0 105 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 MORN4Q8NDC4 146 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 OR4K5Q8NGD3 323 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 UCN3Q969E3 161 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 DPH7Q9BTV6 452 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 GSX2Q9BZM3 304 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ABCG4Q9H172 646 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 RERGLQ9H628 205 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 AHSPQ9NZD4 102 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 MAB21L2Q9Y586 359 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 A0A1W2PPC4 97 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 PLPP1O14494 284 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 PLOD3O60568 738 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 HSD17B2P37059 387 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 RABIFP47224 123 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 YPEL5P62699 121 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 RPS26P62854 115 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ZP2Q05996 745 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 FZD2Q14332 565 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 Q3ZCU0 254 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 TMEM107Q6UX40 140 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 ARL5BQ96KC2 179 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 KLHL31Q9H511 634 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 TBC1D17Q9HA65 648 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 COA4Q9NYJ1 87 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 CCDC88CQ9P219 2028 aa9.59□□□□□ -0.87
APOBEC3F-201ENST00000308521 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 SMIM30A4D0T7 59 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 SSX5O60225 188 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 TNFP01375 233 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 WNT1P04628 370 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 F3P13726 295 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 SLC6A1P30531 599 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 BCL6P41182 706 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 ATP12AP54707 1039 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 GPR18Q14330 331 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 TMEM44Q2T9K0 475 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 TSSK4Q6SA08 328 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 POGLUT1Q8NBL1 392 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 OR2L3Q8NG85 312 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 OR4D10Q8NGI6 311 aa9.59□□□□□ -0.88
APOBEC3F-201ENST00000308521 OTULINQ96BN8 352 aa9.59□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms