RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR7A17O14581 309 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KRBOX4Q5JUW0 171 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 L3MBTL4Q8NA19 623 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR2M2Q96R28 347 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GON7Q9BXV9 100 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD12Q6UB98 2062 aa19.81■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CTDSP2O14595 271 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 BCL7AQ4VC05 210 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35F3Q8IY50 421 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SLC6A14Q9UN76 642 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GAAP10253 952 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ARL3P36405 182 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MACROD1Q9BQ69 325 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RTP3Q9BQQ7 232 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PTTG3PQ9NZH4 202 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf196B1AJZ1 125 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 EDIL3O43854 480 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT7P0C024 238 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TACR1P25103 407 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CAV2P51636 162 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 EMP2P54851 167 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 KCNJ10P78508 379 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF529Q6P280 563 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TSSK4Q6SA08 328 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TAS1R1Q7RTX1 841 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINA12Q8IW75 414 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MYLIPQ8WY64 445 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR5B2Q96R09 309 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CBLCQ9ULV8 474 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV27A0A087WT01 109 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 FAM183AA6NL82 134 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LAMTOR5O43504 91 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RAD1O60671 282 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GIFP27352 417 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 HLA-FP30511 346 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PSPHP78330 225 aa19.8■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TVP23AA6NH52 213 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SDC3O75056 442 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 BMP4P12644 408 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SFTPDP35247 375 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LILRB2Q8N423 598 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 NOX3Q9HBY0 568 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 UBQLN4Q9NRR5 601 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GABRA5P31644 462 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RPS5P46782 204 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR13F1Q8NGS4 319 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ISL2Q96A47 359 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 EMC3Q9P0I2 261 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 HS3ST2Q9Y278 367 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LUMP51884 338 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TATDN3Q17R31 274 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZSR9 355 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF695Q8IW36 515 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PRR22Q8IZ63 422 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR4F15Q8NGB8 312 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 OR5K2Q8NHB8 316 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GABRPO00591 440 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 IFNA4P05014 189 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GYPBP06028 91 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 DAPP51397 102 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa19.79■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CDHR4A6H8M9 788 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ACOT8O14734 319 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 P2RX6O15547 441 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY14Q15391 338 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf38Q5JPI3 329 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RNF175Q8N4F7 328 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 FNDC9Q8TBE3 224 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 MZB1Q8WU39 189 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ASB17Q8WXJ9 295 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D20Q96BZ9 403 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 IL37Q9NZH6 218 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CA14Q9ULX7 337 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 F5H5K5 113 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TAS2R19P59542 299 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 FXYD4P59646 89 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 RTL6Q6ICC9 239 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 LIX1LQ8IVB5 337 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 CHRDQ9H2X0 955 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 J3KTA2 159 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 GJB3O75712 270 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 SEC14L2O76054 403 aa19.78■□□□□ 0.76
CCSAP-201ENST00000284617 TPT1P13693 172 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms