RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262805.16

PDE4C-201, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 2,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-201ENST00000262805 PRKCAP17252 672 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 GZMKP49863 264 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 HCCSP53701 268 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 OR12D2P58182 307 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 BDH1Q02338 343 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 COX18Q8N8Q8 333 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 OR5M3Q8NGP4 307 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 FGF14Q92915 247 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 C4orf36Q96KX1 117 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 KCNN2Q9H2S1 579 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TRIM36Q9NQ86 728 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CMC2Q9NRP2 79 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CYSLTR2Q9NS75 346 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PHF11Q9UIL8 331 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 A0A0G2JK05 382 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CENPBD1B2RD01 187 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 KCNJ13O60928 360 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 STX11O75558 287 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 COL9A1P20849 921 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ACTR1BP42025 376 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ACTR1AP61163 376 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF85Q03923 595 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CRMP1Q14194 572 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SYT9Q86SS6 491 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 GPR135Q8IZ08 494 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ZFAND1Q8TCF1 268 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 HERVK_113Q902F9 699 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TRIM63Q969Q1 353 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 FN3KQ9H479 309 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 IGFLR1Q9H665 355 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ADGRL4Q9HBW9 690 aa15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 EYSQ5T1H1 3165 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 J3QLW9 94 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SLC43A1O75387 559 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PPP1R3DO95685 299 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 LAMP2P13473 410 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ZNF19P17023 458 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 NT5EP21589 574 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 GALP22466 123 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SRP9P49458 86 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SFXN4Q6P4A7 337 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PARM1Q6UWI2 310 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 LYPD8Q6UX82 237 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CEACAM19Q7Z692 300 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CADM2Q8N3J6 435 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 OR5J2Q8NH18 312 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PATE1Q8WXA2 126 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ABHD1Q96SE0 405 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 IL21RQ9HBE5 538 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ADAM30Q9UKF2 790 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 VCANP13611 3396 aa15.47■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 A0A0B4J203 849 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 A0A1W2PPK0 400 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 DBIP07108 87 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 NGFRP08138 427 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 LSSP48449 732 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ARL14Q8N4G2 192 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 C7orf57Q8NEG2 295 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PTCHD1Q96NR3 888 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 FLRT3Q9NZU0 649 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 PILRAQ9UKJ1 303 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 CLEC4AQ9UMR7 237 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 ORC5O43913 435 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SBK2P0C263 348 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SLC2A5P22732 501 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SLC6A1P30531 599 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 GABRA3P34903 492 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 BTCP35070 178 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 SHC2P98077 582 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa15.46■□□□□ 0.07
PDE4C-201ENST00000262805 FIGLAQ6QHK4 219 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms