RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243056.4

HOXC13-201, Transcript of homeobox C13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC13, Length 2,423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13-201ENST00000243056 CD200R1Q8TD46 325 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 FAM3CQ92520 227 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 ZDHHC12Q96GR4 267 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 HHIPQ96QV1 700 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 ACPTQ9BZG2 426 aa18.49■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 LRRK1Q38SD2 2015 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TRPM6Q9BX84 2022 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 CD8B2A6NJW9 211 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 PCDH8O95206 1070 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 WNT1P04628 370 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 CD8BP10966 210 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SDC1P18827 310 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 CCINQ13939 588 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 IFI44LQ53G44 452 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 C12orf73Q69YU5 71 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 LRRN1Q6UXK5 716 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 OAFQ86UD1 273 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TMEM17Q86X19 198 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 GAL3ST1Q99999 423 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 P2RY12Q9H244 342 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 KLF15Q9UIH9 416 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 OR2M5A3KFT3 312 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 IGLON5A6NGN9 336 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 OR2AG2A6NM03 316 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 PRAMEF2O60811 474 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 LY86O95711 162 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 NR2F6P10588 404 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SFTPCP11686 197 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 ADCYAP1P18509 176 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 FNTBP49356 437 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 PGDP52209 483 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 IL2P60568 153 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 GPRC6AQ5T6X5 926 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 AGBL4Q5VU57 503 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SAMD12Q8N8I0 201 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SLC25A28Q96A46 364 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 MAP3K3Q99759 626 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 NTMT1Q9BV86 223 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 FN3KQ9H479 309 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 MED11Q9P086 117 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 NDOR1Q9UHB4 597 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 FZD4Q9ULV1 537 aa18.48■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 ICOSLGO75144 302 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SERPINA3P01011 423 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 CD63P08962 238 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 GIPP09681 153 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 KIR3DL1P43629 444 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 VEGFCP49767 419 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 DGCR2P98153 550 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 CMIPQ8IY22 773 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 ENKD1Q9H0I2 346 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 C5orf52A6NGY3 159 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 UBE2CO00762 179 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TAPBPO15533 448 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 PTGER3P43115 390 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 NUBP1P53384 320 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 GAS1P54826 345 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 WNT3P56703 355 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 DCDP81605 110 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TDGQ13569 410 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 MINDY4Q4G0A6 757 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 MANEAQ5SRI9 462 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 FAM180BQ6P0A1 224 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SLC30A8Q8IWU4 369 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 TPT1P8Q9HAU6 139 aa18.47■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 DBX1A6NMT0 343 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 YY2O15391 372 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 PRKYO43930 277 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SCN2BO60939 215 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 RIDAP52758 137 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SEC23BQ15437 767 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 CCDC157Q569K6 752 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 SLC30A6Q6NXT4 461 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 IQCF1Q8N6M8 205 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 PIGKQ92643 395 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 PPP1R16AQ96I34 528 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 POLE3Q9NRF9 147 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 ZSCAN32Q9NX65 697 aa18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
HOXC13-201ENST00000243056 CKAP5Q14008 2032 aa18.46■□□□□ 0.54
HOXC13-201ENST00000243056 GSAPA4D1B5 854 aa18.45■□□□□ 0.54
HOXC13-201ENST00000243056 ARHGEF33A8MVX0 844 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms