RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641321.1

CASC19-222, Transcript of cancer susceptibility 19, human

BASIC

Gene CASC19, Length 1,173 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-222	ENST00000641321	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ITGA2	P17301	1181 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	GAL	P22466	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	CPOX	P36551	454 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	PPARG	P37231	505 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	CARD18	P57730	90 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	DSCR9	P59020	149 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SKP1	P63208	163 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TPM4	P67936	248 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	RELA	Q04206	551 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SCGB2A2	Q13296	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	GAB1	Q13480	694 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	COTL1	Q14019	142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	EFR3A	Q14156	821 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	GNA13	Q14344	377 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	PDK1	Q15118	436 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	NRF1	Q16656	503 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	P3H1	Q32P28	736 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	BEX5	Q5H9J7	111 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	RTL4	Q6ZR62	310 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ELMO1	Q92556	727 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	FUT8	Q9BYC5	575 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TRIM2	Q9C040	744 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	CENPH	Q9H3R5	247 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	KLHL28	Q9NXS3	571 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321		A8MXE2	369 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	KIAA0513	O60268	411 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	GPRIN2	O60269	458 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	OR56A5	P0C7T3	313 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SLC25A16	P16260	332 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	IGFBP5	P24593	272 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TACR3	P29371	465 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	THBS4	P35443	961 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	KCNJ2	P63252	427 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	RHAG	Q02094	409 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	ZNF704	Q6ZNC4	412 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	KIAA1328	Q86T90	577 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	RASGEF1C	Q8N431	466 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CASC19-222	ENST00000641321	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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