RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ATP1A3	P13637	1013 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMB4	P28070	264 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGAP25	P42331	645 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	GIPR	P48546	466 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	THBS3	P49746	956 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	WNT3A	P56704	352 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	PLIN5	Q00G26	463 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	PAX2	Q02962	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC3A1	Q07837	685 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	GBX1	Q14549	363 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF267	Q14586	743 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	LGSN	Q5TDP6	509 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	DNAJC24	Q6P3W2	148 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CASC4	Q6P4E1	433 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	PIWIL3	Q7Z3Z3	882 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		Q8N3U1	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	TMCO6	Q96DC7	493 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	MUC13	Q9H3R2	512 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	BCO1	Q9HAY6	547 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	EHD3	Q9NZN3	535 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	SORL1	Q92673	2214 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1W2PPW3	197 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	NUDT19	A8MXV4	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		B4DXG7	233 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	C4orf51	C9J302	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	MYO1C	O00159	1063 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CYR61	O00622	381 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	EREG	O14944	169 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ITGA5	P08648	1049 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CECR9	P0C854	216 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	SERPINB4	P48594	390 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	EMD	P50402	254 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CARD18	P57730	90 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	DAG1	Q14118	895 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	E2F2	Q14209	437 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	DPYSL2	Q16555	572 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	C9orf135	Q5VTT2	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		Q6ZS46	218 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	BRAP	Q7Z569	592 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC43A2	Q8N370	569 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	C1orf162	Q8NEQ5	155 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF480	Q8WV37	535 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CCL17	Q92583	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ALG3	Q92685	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	MYDGF	Q969H8	173 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	OMA1	Q96E52	524 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	P2RY12	Q9H244	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	FN3K	Q9H479	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF702P	Q9H963	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	NANOG	Q9H9S0	305 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	RETN	Q9HD89	108 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A088AWK7	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0G2JN53	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0J9YW62	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		C9JVG2	144 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SNAP23-222	ENST00000626061		F8W735	103 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6

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