RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR52Q9Y2T5 361 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.54□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CDHR4A6H8M9 788 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5K3A6NET4 321 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF860A6NHJ4 632 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 EPOPA6NHQ4 379 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 H0Y8X5 98 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CTDSP2O14595 271 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CASKO14936 926 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 PLD2O14939 933 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 PIP5K1CO60331 668 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 FCMRO60667 390 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC19A2O60779 497 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ALX3O95076 343 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC35E2P0CK97 266 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 LIMS3P0CW19 117 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 LIMS4P0CW20 117 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAPPC2P0DI81 140 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAPPC2BP0DI82 140 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 IFI30P13284 250 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CTSEP14091 401 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 GLULP15104 373 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF3P17036 446 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ACSL1P33121 698 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF136P52737 540 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 GAS1P54826 345 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS25P62851 125 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP4K2Q12851 820 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ASAH1Q13510 395 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1Q1Q15612 314 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 GARNL3Q5VVW2 1013 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 NIPAL3Q6P499 406 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 PAQR6Q6TCH4 344 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF550Q7Z398 422 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB43Q86YS6 212 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 NKAIN4Q8IVV8 208 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 LAX1Q8IWV1 398 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CMIPQ8IY22 773 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CA13Q8N1Q1 262 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL4L1Q8NHW4 92 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC2A12Q8TD20 617 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ASB15Q8WXK1 588 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM3CQ92520 227 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 SAMD8Q96LT4 415 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 FCRL4Q96PJ5 515 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 SRRQ9GZT4 340 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52D1Q9H346 318 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNPO2LQ9H987 977 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 HRASLS2Q9NWW9 162 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 ERVK13-1Q9NX77 482 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 MAT2BQ9NZL9 334 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CLEC1BQ9P126 229 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CA5BQ9Y2D0 317 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 V9GYH0 126 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 DOCK8Q8NF50 2099 aa8.53□□□□□ -1.04
EFTUD2-222ENST00000592408 COL4A2P08572 1712 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 HTR3EA5X5Y0 456 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 FABP12A6NFH5 140 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CYR61O00622 381 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CHP2O43745 196 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 FGF17O60258 216 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 BRINP1O60477 761 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAMEF2O60811 474 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TMCC2O75069 709 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 NKX2-2O95096 273 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV3-19P01714 112 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT8P05787 483 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 SAGP10523 405 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 RNH1P13489 461 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 F8A1P23610 371 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC6A6P31641 620 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 TPTEP56180 551 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 CTBP2P56545 445 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.52□□□□□ -1.05
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms