RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 OTX2P32243 289 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 IL22RA1Q8N6P7 574 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ATOH8Q96SQ7 321 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 LPAR4Q99677 370 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV27A0A087WT01 109 aa20.05■□□□□ 0.8
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PTPRM-211ENST00000580170 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 F5H5K5 113 aa20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PTPRM-211ENST00000580170 ICMTO60725 284 aa20.03■□□□□ 0.8
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