RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577524.5

ARHGAP28-208, Transcript of Rho GTPase activating protein 28, human

TSL 5

Gene ARHGAP28, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GTF3C1	Q12789	2109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RELN	P78509	3460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	C7orf72	A4D263	438 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SERINC4	A6NH21	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF195	O14628	629 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TNFSF11	O14788	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RAF1	P04049	648 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	UBTFL6	P0CB48	400 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NPIPA8	P0DM63	369 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR12D1	P0DN82	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TFPI	P10646	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	IDO1	P14902	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	VAMP1	P23763	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ELK4	P28324	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ADH6	P28332	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ARRB2	P32121	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MAP3K8	P41279	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	C21orf58	P58505	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RPS26	P62854	115 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF117	Q03924	483 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MERTK	Q12866	999 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FOXF1	Q12946	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SELENBP1	Q13228	472 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	POU4F3	Q15319	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CD226	Q15762	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	KLHL26	Q53HC5	615 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	BEND4	Q6ZU67	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZAR1	Q86SH2	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CDC20B	Q86Y33	519 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CLECL1	Q8IZS7	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SLC43A2	Q8N370	569 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR5W2	Q8NH69	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FBXO27	Q8NI29	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	STARD4	Q96DR4	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OR52E6	Q96RD3	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SDF2	Q99470	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	POLE3	Q9NRF9	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	JKAMP	Q9P055	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	MKLN1	Q9UL63	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	LIPT1	Q9Y234	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ARHGAP28-208	ENST00000577524	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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