RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM71CQ8NEG0 241 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM239Q8WW34 195 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 MPP4Q96JB8 637 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDC6Q99741 560 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF426Q9BUY5 554 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 FLRT3Q9NZU0 649 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 M0R129 80 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ADAM11O75078 769 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDK1P06493 297 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 CYC1P08574 325 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC5A2P31639 672 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 MASP1P48740 699 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PSPHP78330 225 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PRKCDQ05655 676 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 FNDC7Q5VTL7 733 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 FAM26EQ8N5C1 309 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 TEX47Q8TBZ9 253 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 FGF11Q92914 225 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 LMF1Q96S06 567 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa26.17■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC15A1P46059 708 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACSM5Q6NUN0 579 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC27A4Q6P1M0 643 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 LANCL3Q6ZV70 420 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF441Q8N8Z8 693 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF527Q8NB42 609 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 AGBL5Q8NDL9 886 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSTF1Q92882 214 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ACOT13Q9NPJ3 140 aa26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 A0A1B0GWA3 101 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIP5K1CO60331 668 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 CSTAP01040 98 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PIPP12273 146 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PLA2G5P39877 138 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 RBM34P42696 430 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PCYT1AP49585 367 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMBIM6P55061 237 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 CTBP2P56545 445 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 LINC00114Q6XXX2 140 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 SEMA4CQ9C0C4 833 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 WWTR1Q9GZV5 400 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 EGLN3Q9H6Z9 239 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 APMAPQ9HDC9 416 aa26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 EFCAB10A6NFE3 127 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRIM64BA6NI03 449 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 IDSB3KWA1 339 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBXA2RP21731 343 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 PAX7P23759 505 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 GP2P55259 537 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR107Q5VW38 600 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZNF620Q6ZNG0 422 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 ANKRD37Q7Z713 158 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 DEFB124Q8NES8 71 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR8D4Q8NGM9 314 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 RORBQ92753 470 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 HSPBAP1Q96EW2 488 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 DSN1Q9H410 356 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 TMEM5Q9Y2B1 443 aa26.14■■□□□ 1.78
CTDNEP1-210ENST00000574322 INMTO95050 263 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 HEXBP07686 556 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC29A4Q7RTT9 530 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 IQCF1Q8N6M8 205 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 IL4I1Q96RQ9 567 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 AMBNQ9NP70 447 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 CDH10Q9Y6N8 788 aa26.14■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 SLC30A4O14863 429 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 ALOX12BO75342 701 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR4P46093 362 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 NUDT6P53370 316 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 UBE2UQ5VVX9 321 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 MEDAGQ5VYS4 303 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 ULK3Q6PHR2 472 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 B3GNT7Q8NFL0 401 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 FCGR1BQ92637 280 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 FBXO8Q9NRD0 319 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 GPR83Q9NYM4 423 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TVP23BQ9NYZ1 205 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 MED31Q9Y3C7 131 aa26.13■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 ENTPD6O75354 484 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 UTS2O95399 124 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 NGFRP08138 427 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 MAP2K4P45985 399 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 MC2RQ01718 297 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 TCEANCQ8N8B7 351 aa26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CTDNEP1-210ENST00000574322 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms