RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569192.5

BBS2-219, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 3

Gene BBS2, Length 716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-219	ENST00000569192	CCDC169	A6NNP5	214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	ARPC1B	O15143	372 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	MAPK13	O15264	365 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	PI15	O43692	258 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	KLRC4	O43908	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	TSPAN2	O60636	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	PIGR	P01833	764 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	FCER2	P06734	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	APRT	P07741	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	LMO2	P25791	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	CBX1	P83916	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	CD300C	Q08708	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	SYCP1	Q15431	976 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	CENPP	Q6IPU0	288 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	RAB12	Q6IQ22	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	CHDH	Q8NE62	594 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	C17orf47	Q8NEP4	570 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	TSG101	Q99816	390 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	GRIN2D	O15399	1336 aa		4.97	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	ACACA	Q13085	2346 aa		4.96	□□□□□ -1.61
BBS2-219	ENST00000569192	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CETN3	O15182	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	STX10	O60499	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	LRP3	O75074	770 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TOM1L1	O75674	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TIMP1	P01033	207 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	RSPH10B	P0C881	870 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	GLRA2	P23416	452 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CCNE1	P24864	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ACADSB	P45954	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	GPC3	P51654	580 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TKTL1	P51854	596 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SPAG1	Q07617	926 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CD302	Q8IX05	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	DAW1	Q8N136	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	TEX9	Q8N6V9	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CCNY	Q8ND76	341 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	OR8H1	Q8NGG4	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	MYO7A	Q13402	2215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192		A0A1B0GUA9	196 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CLDN3	O15551	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	ERLIN2	O94905	339 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	SLC4A1	P02730	911 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-219	ENST00000569192	CXCL10	P02778	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms