RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

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Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 GPR119Q8TDV5 335 aa16.77■□□□□ 0.28
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GCSHP2-201ENST00000560971 RUBCNLQ9H714 662 aa16.77■□□□□ 0.28
GCSHP2-201ENST00000560971 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.28
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa16.77■□□□□ 0.28
GCSHP2-201ENST00000560971 CLCF1Q9UBD9 225 aa16.77■□□□□ 0.28
GCSHP2-201ENST00000560971 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.77■□□□□ 0.28
GCSHP2-201ENST00000560971 AP4B1Q9Y6B7 739 aa16.77■□□□□ 0.28
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GCSHP2-201ENST00000560971 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP16.75■□□□□ 0.27
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GCSHP2-201ENST00000560971 PGM1P36871 562 aa16.75■□□□□ 0.27
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GCSHP2-201ENST00000560971 SLC38A5Q8WUX1 472 aa16.74■□□□□ 0.27
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GCSHP2-201ENST00000560971 BCHEP06276 602 aa16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 PRF1P14222 555 aa16.73■□□□□ 0.27
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GCSHP2-201ENST00000560971 ARFIP2P53365 341 aa16.73■□□□□ 0.27
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GCSHP2-201ENST00000560971 P4HA3Q7Z4N8 544 aa16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 LILRA2Q8N149 483 aa16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 C10orf111Q8N326 155 aa16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 METTL25Q8N6Q8 603 aa16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM71CQ8NEG0 241 aa16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 OIT3Q8WWZ8 545 aa16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 MAL2Q969L2 176 aa16.73■□□□□ 0.27
GCSHP2-201ENST00000560971 ENKD1Q9H0I2 346 aa16.73■□□□□ 0.27
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