RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 SLC25A3Q00325 362 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KCNN3Q9UGI6 736 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 IDH3BO43837 385 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZGLP1P0C6A0 271 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 IFNGR1P15260 489 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 STT3AP46977 705 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR1C1Q15619 314 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ISXQ2M1V0 245 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NEIL2Q969S2 332 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TRIB1Q96RU8 372 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MS4A8Q9BY19 250 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 K7EQS6 105 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CD3EP07766 207 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CD22P20273 847 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FAM129BQ96TA1 746 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MND1Q9BWT6 205 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 BOCQ9BWV1 1114 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FBXO8Q9NRD0 319 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CLEC4EQ9ULY5 219 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RNF212BA8MTL3 300 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ETFAP13804 333 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MMP11P24347 488 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ARSDP51689 593 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RAB31Q13636 194 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A19Q695T7 634 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RAB1CQ92928 201 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RAB8BQ92930 207 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LMF1Q96S06 567 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MECRQ9BV79 373 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 WDR54Q9H977 334 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 RNF24Q9Y225 148 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 QSER1Q2KHR3 1735 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NRXN2Q9P2S2 1712 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MYH15Q9Y2K3 1946 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 POM121BA6NF01 834 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 hCG_2039718K7EN88 272 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ACTL6AO96019 429 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CHRM4P08173 479 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GRIA1P42261 906 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CCNIQ14094 377 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 LNX2Q8N448 690 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF709Q8N972 641 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 CORO2AQ92828 525 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TP53INP1Q96A56 240 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SYT3Q9BQG1 590 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 GRHL1Q9NZI5 618 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 P2RX1P51575 399 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FBXO48Q5FWF7 155 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC22A25Q6T423 547 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM64Q6YI46 380 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR8J1Q8NGP2 316 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 OR2Y1Q8NGV0 311 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 FOLH1BQ9HBA9 442 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 DUSP22Q9NRW4 184 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM181Q9P2C4 612 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 MROH6A6NGR9 719 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRB-209ENST00000550857 SYT5O00445 386 aa7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms