RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 ENPP6Q6UWR7 440 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 VTCN1Q7Z7D3 282 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 MARCH3Q86UD3 253 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CLIP4Q8N3C7 705 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 GPR32P1Q8NGA4 272 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ST8SIA1Q92185 356 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZBTB8AQ96BR9 441 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 NRBF2Q96F24 287 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SCMH1Q96GD3 660 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 MPP4Q96JB8 637 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 C7orf34Q96L11 122 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 PRRC1Q96M27 445 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 HS6ST2Q96MM7 605 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 MCHR1Q99705 422 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 PIP5K1AQ99755 562 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 C8orf4Q9NR00 106 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 DNAJB9Q9UBS3 223 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ICAM5Q9UMF0 924 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TRAPPC13A5PLN9 417 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 MASP2O00187 686 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TAF4O00268 1085 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CLOCKO15516 846 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 MGRN1O60291 552 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 NUDT14O95848 222 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CST1P01037 141 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 LDLRP01130 860 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 NPIPA8P0DM63 369 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CCL3P10147 92 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 GP1BBP13224 206 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ITPKBP27987 946 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 IFNGR2P38484 337 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SLC1A3P43003 542 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 DLX5P56178 289 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TAS2R41P59536 307 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZNF117Q03924 483 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ATP6AP1Q15904 470 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 HYAL4Q2M3T9 481 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 COL28A1Q2UY09 1125 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZNF766Q5HY98 468 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 COLEC12Q5KU26 742 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SPINK14Q6IE38 97 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 OR2T5Q6IEZ7 315 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 C5orf46Q6UWT4 87 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 APOOLQ6UXV4 268 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 OLIG3Q7RTU3 272 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 HEATR5AQ86XA9 2040 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 OFCC1Q8IZS5 231 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 OR2T29Q8NH02 315 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ZNF563Q8TA94 476 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 WBP1Q96G27 269 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 MRGPRX4Q96LA9 322 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 REEP1Q9H902 201 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SERINC1Q9NRX5 453 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 RLIMQ9NVW2 624 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CARD8Q9Y2G2 431 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRQ8 180 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 C7orf72A4D263 438 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 PEX1O43933 1283 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CYP7B1O75881 506 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 ZNF17P17021 662 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 SRD5A2P31213 254 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 RRM2P31350 389 aa8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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CS-220ENST00000550700 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 OR1E2P47887 323 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-220ENST00000550700 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
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