RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRK-218ENST00000525459 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
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PTPRK-218ENST00000525459 OIP5O43482 229 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.314e-9■■□□□ 13.2
PTPRK-218ENST00000525459 ACTL6AO96019 429 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRK-218ENST00000525459 ELK4P28324 431 aa16.97■□□□□ 0.31
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