RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	IST1	P53990	364 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CARD18	P57730	90 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	DDX59	Q5T1V6	619 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	NXN	Q6DKJ4	435 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CBLN3	Q6UW01	205 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	OR5W2	Q8NH69	310 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	FBXO27	Q8NI29	283 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	MIPOL1	Q8TD10	442 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	PANX1	Q96RD7	426 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	MED18	Q9BUE0	208 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	POLE3	Q9NRF9	147 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	AIG1	Q9NVV5	245 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		11.3	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	MED12L	Q86YW9	2145 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SERINC4	A6NH21	518 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	C16orf97	H3BN30	126 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SDHD	O14521	159 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF195	O14628	629 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ANKRD28	O15084	1053 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CSTA	P01040	98 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	OR12D1	P0DN82	309 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	IDO1	P14902	403 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	EPHA3	P29320	983 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC7A1	P30825	629 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	NME5	P56597	212 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM27E3	Q08E93	113 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SELENBP1	Q13228	472 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	KEAP1	Q14145	624 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CASP8	Q14790	479 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	TESK1	Q15569	626 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF141	Q15928	474 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SAXO2	Q658L1	398 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	EIF3M	Q7L2H7	374 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF610	Q8N9Z0	462 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	POC1B	Q8TC44	478 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR119	Q8TDV5	335 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM234	Q8WY98	164 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	OSTF1	Q92882	214 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	NEURL3	Q96EH8	262 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ADGRG7	Q96K78	797 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC115	Q96NT0	180 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	NPAS1	Q99742	590 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	FOXC2	Q99958	501 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SERHL2	Q9H4I8	314 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	BTNL2	Q9UIR0	455 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	MKLN1	Q9UL63	735 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	WDR45	Q9Y484	360 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.29	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393		A0A0J9YW62	118 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	FCMR	O60667	390 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SCN2B	O60939	215 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	UGT2B17	O75795	530 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CGA	P01215	116 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	RAF1	P04049	648 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	PRKCA	P17252	672 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	PGC	P20142	388 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	UGT2B10	P36537	528 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	SLC6A8	P48029	635 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	CASP9	P55211	416 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	UFM1	P61960	85 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	QPRT	Q15274	297 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	POU4F3	Q15319	338 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	GUSBP1	Q15486	140 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	HEPHL1	Q6MZM0	1159 aa		11.28	□□□□□ -0.6
RBBP4-215	ENST00000524393	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.28	□□□□□ -0.6

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