RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 C7orf34Q96L11 122 aa20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 RHCGQ9UBD6 479 aa20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.72■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD33BA6NCL7 494 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 SYT5O00445 386 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT36O76013 467 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 RFPL3SP0C7P2 107 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 HTR2AP28223 471 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 ARSKQ6UWY0 536 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 CMIPQ8IY22 773 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 NTNG2Q96CW9 530 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 NPAS1Q99742 590 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 CHID1Q9BWS9 393 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa20.71■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 EXPH5Q8NEV8 1989 aa20.7■□□□□ 0.91
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC3CA6NJW4 275 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXK1P85037 733 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRNB3Q05901 458 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXO1Q12778 655 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM81Q6P7N7 255 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 IGFL3Q6UXB1 125 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 EXD3Q8N9H8 876 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 RELTQ969Z4 430 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 SCMH1Q96GD3 660 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FRMD6Q96NE9 622 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 LAT2Q9GZY6 243 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 ARMC7Q9H6L4 198 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 NDUFAF4Q9P032 175 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 SHISA8B8ZZ34 492 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TIPRLO75663 272 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 NTN1O95631 604 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 MEOX1P50221 254 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TBCELQ5QJ74 424 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2M3Q8NG83 312 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TM9SF4Q92544 642 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 VDAC3Q9Y277 283 aa20.7■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 NINQ8N4C6 2090 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 H0YHG0 523 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX4O95219 450 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 IFNW1P05000 195 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 PTNP21246 168 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FOXK2Q01167 660 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 IQCCQ4KMZ1 466 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TIGD3Q6B0B8 471 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCZ1Q86YW0 608 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 CADM2Q8N3J6 435 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4K17Q8NGC6 315 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 OR1J4Q8NGS1 313 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 MCHR1Q99705 422 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM173AQ9BQD7 235 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 IL1RAPQ9NPH3 570 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 SDHAF3Q9NRP4 125 aa20.69■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 SNPHO15079 494 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FKBP6O75344 327 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 GPIP06744 558 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 LINGO3P0C6S8 592 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 IDH2P48735 452 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 EPS8Q12929 822 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 NADK2Q4G0N4 442 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5W2Q8NH69 310 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 USP24Q9UPU5 2620 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TRAV17A0A0B4J275 112 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM166BA8MTA8 275 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 H0Y3Z8 333 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 H3BNX3 289 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FFAR1O14842 300 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 FABP3P05413 133 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 RAP2AP10114 183 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 MST1P26927 711 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 P2RX1P51575 399 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNC4Q03721 635 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 MISPQ8IVT2 679 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 OIT3Q8WWZ8 545 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM41AQ96HV5 264 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 AP4S1Q9Y587 144 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 EML6Q6ZMW3 1958 aa20.68■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 UMPSP11172 480 aa20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC7A1P30825 629 aa20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 TOMM20Q15388 145 aa20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
TSNARE1-208ENST00000524325 ENTPD8Q5MY95 495 aa20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms