RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 OR1L3Q8NH93 324 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CHPT1Q8WUD6 406 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CANT1Q8WVQ1 401 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TOMM40LQ969M1 308 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TMIGD2Q96BF3 282 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CIB1Q99828 191 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 OMDQ99983 421 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 APOL2Q9BQE5 337 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 BCL7BQ9BQE9 202 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 GID8Q9NWU2 228 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 DDIT4Q9NX09 232 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CMTM6Q9NX76 183 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 GIN1Q9NXP7 522 aa3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CCDC167Q9P0B6 97 aa3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa3.79□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 EI24O14681 340 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PHOX2AO14813 284 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 AZIN1O14977 448 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ATP6V1G1O75348 118 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CDK14O94921 469 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 NPPAP01160 153 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 GNAO1P09471 354 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 VPREB1P12018 145 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 LAMP2P13473 410 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 MMP9P14780 707 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CD1DP15813 335 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 LBPP18428 481 aa3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CDH3P22223 829 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 IL10P22301 178 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PAX3P23760 479 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 HTR1EP28566 365 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 OXTRP30559 389 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 EPHX2P34913 555 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ARL3P36405 182 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 RPS9P46781 194 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 LHX1P48742 406 aa3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 TMED1Q13445 227 aa3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 TYSND1Q2T9J0 566 aa3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 DUSP28Q4G0W2 176 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CYBRD1Q53TN4 286 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ELFN2Q5R3F8 820 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 WSCD1Q658N2 575 aa3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 ISLR2Q6UXK2 745 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 CHST9Q7L1S5 443 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SPATA19Q7Z5L4 167 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 CLYBLQ8N0X4 340 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ZNF786Q8N393 782 aa3.78□□□□□ -1.8
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SGCE-211ENST00000522045 IPMKQ8NFU5 416 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 OR52E4Q8NGH9 312 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 OR9I1Q8NGQ6 314 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 FAM110BQ8TC76 370 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TWIST2Q8WVJ9 160 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.78□□□□□ -1.8
SGCE-211ENST00000522045 PCED1BQ96HM7 432 aa3.78□□□□□ -1.8
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